结论：原告是否可以主张全部工资，取决于被告将工资做在两家公司的具体操作方式以及相关证据情况。以下从不同角度进行分析：
一、若两家公司存在关联关系，且工资支付存在混同
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关司法解释，如果两家公司存在关联关系（如母子公司、兄弟公司等），且在实际操作中工资支付存在混同，即被告的工资实际上是由两家公司共同支付或其中一家公司代为支付，那么原告在起诉时，虽然只与其中一家公司签订了劳动合同，但仍有权主张全部工资。
法律建议：
- 原告应收集相关证据，如工资条、银行转账记录、公司之间的资金往来记录等，以证明两家公司存在关联关系且工资支付存在混同。
- 在起诉时，可以将两家公司作为共同被告，要求其共同承担支付工资的责任。
二、若两家公司无关联关系，且工资支付独立
法律背景：
- 如果两家公司无关联关系，且被告的工资是由两家公司分别独立支付的，那么原告在起诉时，只能主张与签订劳动合同的那家公司相关的工资部分。
- 在这种情况下，原告需要证明与另一家公司之间不存在劳动关系，且该公司的工资支付与原告无关。
法律建议：
- 原告应仔细审查与两家公司的合同关系及工资支付情况，确保只主张与签订劳动合同的那家公司相关的工资。
- 如果原告认为另一家公司也应当承担支付工资的责任，需要收集相关证据证明其与该公司之间存在劳动关系或应当承担支付工资的其他法定情形。
三、若存在恶意逃避债务或欺诈行为
法律背景：
- 如果被告将工资做在两家公司是为了恶意逃避债务或进行欺诈行为，那么这种行为可能违反了《中华人民共和国民法典》中关于诚实信用原则的规定。
- 在这种情况下，法院可能会根据实际情况，判决被告承担全部工资支付责任，甚至可能对其处以罚款或其他法律制裁。
法律建议：
- 原告应收集相关证据，证明被告存在恶意逃避债务或欺诈行为，如虚假合同、伪造工资条等。
- 在起诉时，可以向法院提出相应的主张，并要求法院对被告的违法行为进行制裁。
进一步思考：在处理此类案件时，关键在于收集和提供充分的证据来证明被告的工资支付情况以及两家公司之间的关系。因此，建议原告在起诉前尽可能收集相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答。