劳动关系终止协议撤销后，用人单位已支付的一部分补偿金是否需要归还，这主要取决于协议撤销的原因以及双方的具体约定。以下从不同角度进行分析：
一、协议撤销的原因
因欺诈、胁迫或乘人之危而撤销：
- 如果劳动关系终止协议是因为用人单位存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，导致劳动者在违背真实意思的情况下签订了协议，那么劳动者有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。
- 在协议被撤销后，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因该协议取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。因此，如果劳动者已经收到了部分补偿金，且该补偿金是基于被撤销的协议而取得的，那么劳动者理论上需要归还这部分补偿金。但实际操作中，如果补偿金已经用于生活开支等必要支出，且劳动者没有其他财产可以返还，那么可能不需要全额归还，而是根据具体情况进行折价补偿。
因重大误解或显失公平而撤销：
- 如果协议是因为双方对协议内容存在重大误解，或者协议内容显失公平（如用人单位支付的补偿金远低于法定标准），导致劳动者在签订协议时未能充分表达自己的真实意愿，那么劳动者同样有权请求撤销协议。
- 在这种情况下，如果劳动者已经收到了部分补偿金，且该补偿金与法定标准或双方实际应支付的金额存在显著差异，那么劳动者可能需要归还超出部分或根据法院/仲裁机构的裁决进行相应调整。但同样，如果劳动者已经将补偿金用于必要支出，且没有其他财产可以返还，那么可能不需要全额归还。
二、双方的具体约定
- 协议中是否有关于撤销后补偿金处理的条款：如果劳动关系终止协议中明确约定了协议撤销后补偿金的处理方式（如是否需要归还、如何归还等），那么双方应当按照协议约定执行。
- 双方是否达成新的协议：在协议撤销后，双方也可以就补偿金的归还问题达成新的协议。如果双方能够协商一致，那么按照新协议执行即可。
三、实际操作建议
- 保留相关证据：无论协议撤销的原因是什么，劳动者都应当保留好与协议签订、履行以及撤销相关的所有证据（如协议文本、支付凭证、沟通记录等），以便在需要时证明自己的权益。
- 及时咨询专业律师：由于劳动关系终止协议撤销后的补偿金处理问题涉及复杂的法律关系和事实认定，因此建议劳动者在遇到此类问题时及时咨询专业律师，以便获得更具体、更准确的法律建议。
总结来说，劳动关系终止协议撤销后，用人单位已支付的一部分补偿金是否需要归还，取决于协议撤销的原因以及双方的具体约定。如果是因为用人单位的欺诈、胁迫或乘人之危等情形导致协议撤销，且劳动者已经收到了部分补偿金，那么劳动者理论上需要归还这部分补偿金（或根据具体情况进行折价补偿）。如果是因为重大误解或显失公平导致协议撤销，且补偿金与法定标准或双方实际应支付的金额存在显著差异，那么劳动者可能需要归还超出部分或根据法院/仲裁机构的裁决进行相应调整。在实际操作中，建议劳动者保留好相关证据并及时咨询专业律师。