事业单位发放加班费的依据主要来源于我国相关的劳动法律法规，以下是对此问题的详细解答：
首先，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，事业单位在安排劳动者加班时，需要按照以下标准支付加班费：
工作日延长工作时间：如果事业单位在工作日安排劳动者延长工作时间，那么需要支付不低于劳动者正常工作时间工资的百分之一百五十的工资报酬。
休息日加班：若在休息日安排劳动者工作且无法安排补休，事业单位需支付不低于劳动者正常工作时间工资的百分之二百的工资报酬。
法定休假日加班：在法定休假日安排劳动者工作的，事业单位应支付不低于劳动者正常工作时间工资的百分之三百的工资报酬。
此外，虽然《中华人民共和国劳动法》第四十七条提到用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平，但这并不影响加班费的支付标准，加班费是法定的，必须按照上述标准执行。
同时，还有一些其他相关规定也涉及到了加班或特殊工作时间的工资补贴，例如：
《最低工资规定》中明确，在劳动者提供正常劳动的情况下，用人单位应支付给劳动者的工资在剔除延长工作时间工资等特殊津贴后，不得低于当地最低工资标准。
《人力资源社会保障部办公厅技能人才薪酬分配指引》中提到，夜班津贴是对劳动者在夜晚工作额外付出的补偿，主要适用于基本生产技能岗位人员，并给出了夜班津贴的一般标准范围。
特定行业如煤矿等，还有关于井下艰苦岗位津贴的具体规定，其中也包括了夜班津贴的标准。
虽然这些规定可能并不直接针对事业单位，但它们体现了我国对于劳动者加班和特殊工作时间工资补贴的普遍原则和态度。事业单位在发放加班费时，应参照这些法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。
综上所述，事业单位发放加班费的依据主要是《中华人民共和国劳动法》中关于加班费支付标准的规定，同时也要考虑其他相关法律法规中关于特殊工作时间工资补贴的原则。