结论：签合同时发现第二份没有印下去，是可以手写的，但需要注意手写内容的合法性、双方的一致性以及手写后的保存和备份等问题。
详细分析：
手写内容的合法性：
- 手写部分应当符合法律法规的规定，不得包含违法或无效的内容。例如，手写部分不能违反法律的强制性规定，也不能损害国家、集体或第三人的利益。
- 手写部分应当与打印部分的内容相协调，不得产生矛盾或冲突。如果手写部分与打印部分存在不一致，应当明确以哪部分为准，或者通过双方协商达成一致意见。
双方的一致性：
- 手写部分必须得到合同双方的认可和同意。在签署合同前，双方应当仔细阅读手写部分的内容，并确认其真实性和准确性。
- 如果手写部分涉及合同的重要条款或变更，建议双方在手写部分签字或盖章，以确认其效力。这有助于避免未来可能出现的纠纷或争议。
手写后的保存和备份：
- 签署完手写部分后，合同双方应当妥善保存合同原件，并可以考虑制作副本或扫描件进行备份。这有助于在合同丢失或损坏时，能够迅速恢复合同内容。
- 如果合同涉及重要的商业交易或法律权益，建议将合同原件存放在安全的地方，并告知相关人员合同的存在和重要性。
法律建议：
- 在签署合同前，建议双方仔细阅读合同条款，特别是手写部分的内容，确保其真实、准确且合法。
- 如果对手写部分的内容存在疑问或不确定，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以避免未来可能出现的法律风险。
- 签署合同后，双方应当遵守合同约定，履行各自的义务和责任。如果发生纠纷或争议，应当通过合法途径解决，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
可能后果：
- 如果手写部分的内容违法或无效，可能会导致合同整体无效或部分无效，从而给双方带来不必要的损失和风险。
- 如果手写部分的内容与打印部分存在矛盾或冲突，且双方未能达成一致意见，可能会导致合同执行困难或产生纠纷。
- 如果手写部分未得到双方的认可和同意，或者未妥善保存和备份合同原件，可能会在未来出现合同丢失、损坏或无法证明合同内容等情况。
因此，在签合同时发现第二份没有印下去而选择手写时，请务必注意上述问题，并咨询专业律师或法律顾问的意见以确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。