工伤后继续上班，辞职时是否有补偿，主要取决于工伤认定等级、当时处理结果以及后续伤情变化等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、工伤认定与伤残等级的影响
若工伤被认定且经劳动能力鉴定委员会评定存在伤残等级：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，员工离职时有权享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。
- 一次性工伤医疗补助金：由工伤保险基金支付，用于医疗康复等。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，通常与伤残等级和当地实际情况相关。
- 一次性伤残就业补助金：由用人单位支付，补偿因工伤导致的就业能力影响。同样，具体标准也由省、自治区、直辖市人民政府规定。
若工伤未被认定或未评定伤残等级：
- 一般情况下，员工在辞职时可能无法直接获得上述两项补助金。但若工伤导致后续损失或伤情发生变化，员工仍可申请工伤认定和劳动能力鉴定，并据此要求公司赔付。
二、工伤处理结果与协议的影响
若工伤后已得到相应赔偿，并与公司就工伤问题达成协议：
- 两年后辞职时，员工通常不再有额外赔付。但需注意，协议内容应合法合规，且不得损害员工的合法权益。
若工伤未得到妥善处理：
- 如未拿到应有赔偿或伤情发生变化，员工可申请工伤认定和劳动能力鉴定，并要求公司赔付。此时，员工需提供相关证据，如医疗证明、工伤认定书、劳动能力鉴定书等，以支持其主张。
三、其他可能的赔付情况
经济补偿：
- 若公司存在《劳动合同法》规定的过错情形（如未提供劳动保护、未及时支付劳动报酬、未缴纳社会保险费等），员工以此为由辞职时，公司应支付经济补偿。经济补偿的标准按工作年限计算，每满一年支付一个月工资。
工伤复发或后续治疗：
- 若工伤复发或需要后续治疗，员工仍可享受工伤医疗待遇。此时，员工应及时向公司报告，并按照规定程序申请工伤认定和医疗费用报销。
四、实际操作建议
及时申请工伤认定和劳动能力鉴定：
- 员工在受伤后应及时按照规定程序进行工伤认定申请，并在伤情稳定后申请劳动能力鉴定。这是后续主张赔偿的重要依据。
保留相关证据：
- 员工应妥善保管与工伤相关的医疗证明、工伤认定书、劳动能力鉴定书等证据材料。这些材料在后续主张赔偿时将起到关键作用。
了解当地政策和标准：
- 由于一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，因此员工在主张赔偿前应了解当地的相关政策和标准。
总结来说，工伤后继续上班两年再辞职，公司是否需要赔付取决于多种因素。若存在伤残等级且未获得充分赔偿，或工伤导致后续损失，员工有权要求公司赔付。因此，在做出辞职决定前，建议员工充分了解自己的权益和可能的赔偿情况，并咨询专业律师（即本人）以获取更具体的法律建议。