公司申请工伤认定缺资料确实会产生一定影响，具体影响程度取决于缺失资料的种类和重要性。以下从不同角度为你详细分析：

一、可能影响工伤认定的进程

1. 延迟认定时间：工伤认定需要提交一系列完整的资料，包括工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）等。如果缺失关键资料，如劳动关系证明或医疗诊断证明，社保行政部门将无法启动认定程序，导致认定时间延迟。
2. 增加补正资料的环节：在提交工伤认定申请后，如果社保行政部门发现资料不全，会要求申请人补正资料。这不仅会延长认定时间，还可能给申请人带来额外的麻烦和成本。

二、可能影响工伤认定的结果

1. 无法认定工伤：如果缺失的资料是认定工伤的关键证据，如事故现场照片、证人证言等，且无法通过其他方式补正，那么可能导致无法认定工伤。这将直接影响劳动者享受工伤保险待遇的权利。
2. 认定工伤的难度增加：即使缺失的资料不是关键证据，但也可能增加认定工伤的难度。例如，如果缺失医疗诊断证明，社保行政部门可能难以判断劳动者的伤害是否与工作有关，从而增加认定工伤的不确定性。

三、应对建议

1. 及时补正资料：如果发现申请工伤认定时缺失资料，应尽快与用人单位沟通，收集并补正相关资料。同时，也可以向社保行政部门咨询，了解具体需要补正哪些资料以及补正的流程和时间要求。
2. 保留相关证据：在补正资料的过程中，应尽可能保留与工伤认定相关的所有证据，如事故现场照片、证人证言、医疗记录等。这些证据将有助于证明工伤事实，提高认定工伤的成功率。
3. 寻求法律帮助：如果对工伤认定流程或所需资料有疑问，或者遇到用人单位不配合补正资料的情况，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询和代理服务，帮助劳动者维护自己的合法权益。

总结来说，公司申请工伤认定时缺失资料确实会产生一定影响，可能延迟认定时间、增加补正资料的环节、影响认定结果等。因此，建议用人单位和劳动者在申请工伤认定时，务必准备齐全相关资料，并按照规定的流程进行申请。如果遇到问题或疑问，可以及时向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。