员工在不知情的情况下，若公司实施了违法行为，其法律责任需结合具体情况分析。一般而言，员工无需承担刑事责任，但在某些情况下可能需承担民事责任或面临行政处理。以下是对此问题的详细分析：

一、刑事责任认定

1. 原则：刑事责任的认定遵循主客观相统一原则。这意味着，要构成犯罪，不仅需要有客观的违法行为，还需要有主观上的故意或过失。若员工确实不知公司行为违法，且无故意或过失，通常不会被认定构成犯罪。
2. 举例：例如，公司以合法名义进行非法活动，如非法集资、传销等，而普通员工对此毫不知情，仅按照公司指令执行工作，则不构成共犯。
3. 特殊情况：然而，若员工明知或应知公司违法仍参与，或者未采取必要措施防止违法行为的发生，则需承担相应的刑事责任。此外，对于公司的高管，如董事、监事等，由于其职责所在，需对公司行为更加关注，若因疏忽导致公司违法，也可能承担刑事责任。

二、民事责任承担

1. 职务行为导致损失：员工在执行公司指令时，即使不知情，但若其行为造成他人损害，公司需承担赔偿责任。在特定情况下，员工可能根据其过错程度承担部分补充赔偿责任。例如，员工在执行公司指令时因疏忽大意导致他人受伤，公司需承担主要赔偿责任，而员工可能因过错承担部分补充责任。
2. 表见代理情况：若员工行为构成表见代理，即员工以公司名义与他人进行民事活动，使善意相对人相信其有代理权，而实际上员工并无代理权，若因此使善意相对人受损，员工可能与公司一起承担连带责任。但员工在承担责任后，有权向公司追偿。

三、行政处理及后果

1. 配合调查义务：员工在公司违法行为被发现后，有义务配合行政机关的调查，提供相关信息和证据。这是员工的法定义务，若拒绝配合，可能面临行政处罚。
2. 禁止从业限制：在特定行业下，公司违法行为可能导致相关从业人员受到从业限制。即使员工不知情，也可能因公司的违法行为而受到影响。例如，金融行业中的某些违法行为可能导致相关从业人员被禁止从事该行业一段时间或终身。
3. 职业影响：公司违法行为还可能导致员工失业，并在未来求职时成为不利因素。若违法行为严重影响行业声誉，更将增加员工就业难度。

四、员工应对措施

1. 提高法律意识：员工应了解公司业务和法律风险，增强自我保护意识。通过参加法律培训、阅读相关法律法规等方式提高自己的法律素养。
2. 及时反映问题：若发现公司存在违法行为，应立即向公司提出质疑并向有关部门反映。这不仅可以避免自身受牵连，还可以维护社会公共利益。
3. 寻求专业帮助：在发现公司异常时，可咨询专业律师以获取专业建议和指导。律师可以根据具体情况为员工提供法律意见和解决方案。

综上所述，员工在不知情的情况下若公司实施违法行为，其法律责任需根据具体情况综合判断。员工应时刻保持警惕，积极采取措施以维护自身合法权益并规避潜在法律风险。若您有任何法律问题或疑虑，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。