结论前置：合同中约定保证不退还的款项，在符合法律规定且双方意思表示真实的情况下，可以用保证金收据和合同作为入账的依据，但需确保合同条款合法合规，并遵循相关财务和税务规定。以下从不同角度进行详细分析：
一、合同条款的合法性
保证金条款的有效性：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方可以约定保证金条款，作为履行合同的担保。只要该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，且双方意思表示真实，该条款即有效。
- 若合同中明确约定了保证金不退还的条件，且这些条件不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该约定在合同双方之间具有法律约束力。
合同内容的合法性审查：
- 在将保证金收据和合同作为入账依据前，应确保合同内容合法合规，不包含任何违法或无效条款。例如，合同不得约定违反法律、行政法规的强制性规定，如欺诈、胁迫、恶意串通等行为。
二、入账依据的合规性
保证金收据的合规性：
- 保证金收据应作为收款凭证，明确记载收款人、付款人、收款金额、收款事由等信息。这是入账的基本要求，也是财务和税务部门审查的重要依据。
- 确保保证金收据的真实性和合法性，避免使用虚假或伪造的收据进行入账。
合同的合规性：
- 合同作为双方权利义务的约定，是入账的重要依据之一。在入账时，应提供完整的合同文本，以证明保证金不退还的条款是双方真实意思的表示。
- 合同应符合相关法律法规的规定，如合同形式、内容、签订程序等均应合法合规。
三、财务和税务规定
财务规定：
- 根据企业财务制度的规定，企业应按照实际发生的经济业务事项进行会计核算，确保会计信息的真实性和完整性。因此，在将保证金收据和合同作为入账依据时，应确保这些凭证真实反映了企业的经济业务。
- 企业应建立健全的内部控制制度，对入账凭证的审核、保管等环节进行规范，以防止虚假入账等违法行为的发生。
税务规定：
- 在税务方面，企业应按照税法规定进行纳税申报和缴纳税款。保证金不退还的款项可能涉及增值税、企业所得税等税种的缴纳问题。因此，在入账时，应充分考虑税务因素，确保合规纳税。
- 企业应保留好相关凭证和资料，以备税务部门进行税务稽查时提供证明。
四、实际操作建议
完善合同条款：
- 在签订合同时，应明确约定保证金不退还的条件和程序，以及双方的权利义务等条款。这有助于减少后续纠纷的发生，并为入账提供明确的依据。
规范凭证管理：
- 企业应建立健全的凭证管理制度，对保证金收据和合同等凭证进行规范管理。确保凭证的真实性、合法性和完整性，以便在入账时提供有效的证明。
咨询专业人士：
- 在涉及复杂法律或财务问题时，建议咨询专业律师或财务人员的意见。他们可以提供专业的指导和建议，帮助企业合规入账并降低法律风险。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。