针对您提出的“多年后发现建设单位和物业企业未通过招标进驻并签物业合同，主管部门应如何处理”的问题，核心结论在于主管部门会根据具体情况，采取责令改正、罚款、撤销合同或行政处分等措施。以下是对此问题的详细分析：
责令改正：
- 根据《物业管理条例》的相关规定，国家提倡建设单位按照房地产开发与物业管理相分离的原则，通过招投标的方式选聘具有相应资质的物业服务企业。若建设单位和物业企业未通过招标程序即进驻并签订物业合同，主管部门首先会责令其限期改正，即要求建设单位重新通过招投标程序选聘物业服务企业，或要求物业企业退出项目，由符合规定的物业服务企业接管。
罚款：
- 若建设单位和物业企业未按照主管部门的责令改正要求执行，或情节较为严重，主管部门有权对其处以罚款。罚款的数额会根据违法行为的情节轻重、造成的后果等因素综合确定，旨在通过经济手段惩罚违法行为，并起到警示作用。
撤销合同或确认合同无效：
- 在某些情况下，如果未通过招标程序签订的物业合同严重违反了法律法规的强制性规定，或损害了公共利益、业主权益等，主管部门或相关法院可能会根据申请或职权，撤销该合同或确认其无效。这将导致合同自始不具有法律效力，建设单位和物业企业需承担由此产生的法律责任。
对相关责任人员的行政处分：
- 如果建设单位和物业企业的违法行为涉及到了相关责任人员（如建设单位负责人、物业企业高管等），且这些责任人员在违法行为中起到了关键作用或负有直接责任，主管部门或相关监察机关可能会对其给予行政处分，如警告、记过、降级、撤职等。
额外建议：
- 对于业主而言，如果发现建设单位和物业企业存在未通过招标程序即进驻并签订物业合同的情况，可以向当地房地产主管部门或物业管理协会进行投诉举报，以维护自身合法权益。
- 同时，业主也可以积极组织或参与业主大会，通过民主程序选聘符合规定的物业服务企业，以改善物业管理状况。
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