结论：对于“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚”这一规定，在决定是否给予行政处罚前，确实需要调查是否存在违法行为。但这一调查行为本身，并不意味着一定会对违法行为进行处罚，还需考虑违法行为是否在二年内被发现，以及是否存在其他特殊情形。
详细解释与法律依据：
一般原则：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，原则上不再给予行政处罚。这一规定体现了法律对时效性的考量，旨在保护当事人的合法权益，避免长期悬而未决的法律纠纷，同时也促使行政机关及时高效地行使职权。
- 调查必要性：在决定是否给予行政处罚前，行政机关必须首先确认是否存在违法行为。这是行政处罚的前提和基础。如果经过调查发现不存在违法行为，那么自然无需考虑处罚问题。如果存在违法行为，再进一步判断是否在二年内被发现。
特殊情形：
- 对于涉及公民生命健康安全、金融安全且造成实际危害后果的违法行为，上述的二年期限将被延长至五年。这意味着，即使这类违法行为在二年内未被发现，但在五年内被查处，行政机关依然有权对其进行行政处罚。
- 调查与处罚的关系：在特殊情形下，即使违法行为在二年内未被发现，但只要在五年内被发现，且符合其他处罚条件，行政机关仍然可以依法进行处罚。因此，调查是否存在违法行为是这一过程中的关键环节。
期限的计算方式：
- 追溯期限一般从违法行为发生之日起计算。若违法行为是连续或继续状态的，则从行为终了之日起算。例如，某企业持续数月偷排污水，那么追溯期限将从其停止偷排污水的日期开始计算。
- 调查的作用：在计算追溯期限时，调查行为有助于确定违法行为的具体发生时间和终止时间，从而准确判断是否在处罚时效内。
避免重复处罚与例外情况：
- 根据同一法律规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。如果同一个违法行为违反了多个法律规范并应受罚款处罚，将按照罚款数额高的规定进行处罚。
- 例外规定：除了上述涉及公民生命健康安全、金融安全的特殊情况外，如果其他法律对追诉时效有特别的规定，也应当遵循那些特殊的规定。这要求在实际应用中，必须根据具体情况来判断是否可以对违法行为进行行政处罚。
举例说明：
一般情况示例：张三于2023年1月1日开始无照经营一家小摊贩，并未办理相关营业执照。如果该违法行为在2025年1月1日之前未被执法部门发现，并且之后也没有再持续发生，那么张三的无照经营行为将不会再受到行政处罚。但在此之前，执法部门需要调查确认张三确实存在无照经营的行为。
特殊情况示例：李四在2023年1月1日开始生产销售不符合食品安全标准的食品，导致消费者出现身体不适（涉及公民生命健康安全且有危害后果）。该违法行为一直持续到2023年6月1日才停止。在这种情况下，对李四的违法行为进行行政处罚的期限将从2023年6月1日起算，延长至五年后的2028年6月1日。如果在此期间内执法部门未发现该违法行为，那么之后将不能再对李四进行行政处罚。但同样，在此之前，执法部门需要调查确认李四确实存在生产销售不符合食品安全标准食品的行为。
建议：
由于“二年未发现”原则及其例外情况在行政处罚中具有重要意义，当事人在面临相关问题时应积极配合行政机关的调查工作，并咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。同时，行政机关也应严格遵循法律规定，确保行政处罚的合法性和合理性。如果你有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。