违法行为在二年内未被发现的，一般不再给予行政处罚，但涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年，法律另有规定的除外。关于是否立案，需结合具体情况判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 一般情况下的处理原则：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，违法行为在二年内未被发现的，行政机关原则上不再给予行政处罚。这一规定体现了法律对时效性的考量，旨在保护当事人的合法权益，避免长期悬而未决的法律纠纷，同时也促使行政机关及时高效地行使职权。
   • 举例：若某商家在2023年1月1日存在欺诈消费者的行为，且该行为在2025年1月1日之前未被市场监管部门查处，那么之后通常不能再就该次欺诈行为进行处罚。

2. 特殊情况下的处理原则：

   • 当违法行为涉及公民生命健康安全、金融安全，并且产生了实际的危害后果时，追溯期限从常规的2年延长至5年。这意味着，即使这类违法行为在2年内未被发现，但在5年的期限内被查处，行政机关依然有权对其进行行政处罚。
   • 举例：若某制药企业在2023年1月1日生产的不合格药品对消费者造成了健康损害，即使该行为在2年内未被发现，但在5年内被查实，仍可受到行政处罚。

3. 关于立案的判断：

   • 立案标准：立案通常取决于违法行为的性质、情节、危害后果以及是否符合行政机关的立案条件。即使违法行为在二年内未被发现，但如果其性质严重、情节恶劣或危害后果显著，且符合立案条件，行政机关仍可能依法立案调查。
   • 特殊情况下的立案：对于涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的违法行为，即使超过二年但未超过五年，行政机关在发现后仍可能立案调查并给予行政处罚。

4. 期限的计算方式：

   • 追溯期限一般从违法行为发生之日起计算。若违法行为是连续或继续状态的，则从行为终了之日起算。例如，某企业持续数月偷排污水，那么追溯期限将从其停止偷排污水的日期开始计算。

5. 例外情况与特殊规定：

   • 除了上述涉及公民生命健康安全、金融安全的特殊情况外，如果其他法律对追诉时效有特别的规定，也应当遵循那些特殊的规定。这要求在实际应用中，必须根据具体情况来判断是否可以对违法行为进行行政处罚。

建议：

• 对于当事人而言，如果面临可能的违法行为指控，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
• 对于行政机关而言，应严格遵循法律规定，确保行政处罚的合法性和合理性，避免滥用职权或怠于行使职权。

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