公司可以协助员工申请工伤劳动能力鉴定，但最终申请责任主体为员工本人，公司有配合义务。具体分析如下：
- 公司协助申请的合法性
根据《工伤保险条例》及《工伤职工劳动能力鉴定管理办法》，公司作为工伤保险缴费义务方，在员工发生工伤后有义务协助员工完成工伤认定及劳动能力鉴定流程。具体包括：
- 提供工伤认定申请表、劳动关系证明、医疗诊断证明等材料；
- 协助员工向设区的市级劳动能力鉴定委员会提交鉴定申请；
- 安排员工参加现场鉴定（如需）。
- 员工本人的申请主体资格
劳动能力鉴定的直接申请权属于员工本人。若公司未主动协助，员工可自行向劳动能力鉴定委员会申请，需提交以下材料：
- 工伤认定决定书原件及复印件；
- 有效的诊断证明、完整病历材料（如X光片、CT报告等）；
- 身份证原件及复印件；
- 劳动能力鉴定委员会要求的其他材料。
- 公司拒绝协助的应对措施
若公司以各种理由推诿或拒绝协助，员工可采取以下行动：
- 向劳动监察部门投诉：要求公司履行法定义务；
- 自行申请鉴定：直接向劳动能力鉴定委员会提交材料，流程不受影响；
- 申请法律援助：若因公司过错导致鉴定延误，可主张赔偿（如停工留薪期工资损失等）。
温馨提示：劳动能力鉴定结论是确定工伤待遇（如伤残补助金、医疗补助金）的关键依据，建议员工在伤情稳定后尽快申请。若对流程或材料有疑问，可直接向我咨询，我将结合您的具体情况提供详细指导。