物流公司老板用个人微信收取运费，这一行为本身并不直接违法，但可能存在法律风险和合规性问题，具体分析如下：

1. 法律性质与风险：

   • 个人行为与公司行为区分：如果物流公司老板以个人名义，使用个人微信收取运费，且该运费并未纳入公司财务账户，这可能被视为个人行为。然而，若该行为被认定为代表公司进行的经营活动，则可能涉及公司财务与个人财务的混同，违反公司法中关于公司财产独立性的规定。
   • 税务合规性：个人收取运费可能涉及税务问题。如果运费收入未纳入公司税务申报，可能导致公司税务不实，进而引发税务风险。此外，个人收取大额运费也可能被税务机关关注，要求说明资金来源及纳税情况。
   • 合同履行与证据留存：使用个人微信收取运费，可能在合同履行过程中留下证据瑕疵。一旦发生纠纷，如运费支付问题、货物损失赔偿等，个人微信聊天记录作为证据可能不如公司正式财务记录具有说服力。

2. 合规建议：

   • 明确收款主体：物流公司应明确收款主体，建议使用公司对公账户收取运费，以确保财务清晰、合规。
   • 完善内部管理：公司应建立完善的财务管理制度，规范运费收取、记录、申报等流程，避免个人与公司财务混同。
   • 保留证据：如确实需要使用个人微信收取运费，应确保聊天记录、转账记录等证据的完整性和真实性，以便在发生纠纷时提供有力支持。

3. 可能后果：

   • 行政处罚：如果物流公司老板的个人行为被认定为违反公司法或税务法规，可能面临行政处罚，如罚款、滞纳金等。
   • 民事纠纷：因个人微信收取运费导致的合同履行问题，可能引发民事纠纷，如运费支付纠纷、货物损失赔偿纠纷等。
   • 刑事责任：在极端情况下，如果个人微信收取运费的行为被认定为诈骗、挪用资金等犯罪行为，可能承担刑事责任。

总结来说，虽然物流公司老板用个人微信收取运费本身不直接违法，但存在诸多法律风险和合规性问题。为了降低风险，建议物流公司规范财务管理，明确收款主体，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。