建筑工程施工合同纠纷中垂直运输费用的计取，需根据合同约定、行业惯例及实际施工情况综合确定，具体分析如下：

1. 合同有明确约定时
   若合同中已对垂直运输费用的计取方式（如按建筑面积、工期、设备台班或实际工程量等）作出明确约定，原则上应优先适用合同约定。此时需重点审查：

   • 合同条款是否清晰无歧义（如“垂直运输费包含在综合单价中”或“按塔吊使用台班计费”）；
     
   • 约定是否违反法律强制性规定（如显失公平或恶意串通）；
     
   • 实际履行是否与约定一致（如设备型号、使用时间是否符合合同要求）。
     若合同约定合法有效且已实际履行，法院或仲裁机构通常直接依据约定裁判。

2. 合同未约定或约定不明时
   若合同未约定或约定模糊，可参考以下规则确定计取方式：

   • 行业惯例：根据《建设工程工程量清单计价规范》（GB 50500-2013）等规范，垂直运输费通常按“建筑面积×单位造价”或“机械台班×单价”计算，具体需结合工程类型（如住宅、商业综合体）和施工方案（如塔吊、施工电梯配置）确定。
     
   • 实际成本：若承包人能证明实际发生的垂直运输费用（如设备租赁合同、台班记录、人工搬运凭证等），可主张按实际成本补偿，但需扣除合理利润部分。
     
   • 公平原则：法院可能根据双方过错、工程实际需求（如超高层建筑需增加垂直运输设备）等因素，酌情调整费用标准。
     

3. 争议焦点与举证责任

   • 承包人主张费用：需提供证据证明垂直运输设备的型号、数量、使用时间及费用构成（如租赁合同、发票、台班签收单）。
     
   • 发包人抗辩：若发包人主张承包人未合理使用设备或费用过高，需提供反证（如监理日志、第三方评估报告）。
     若双方均无法充分举证，法院可能委托鉴定机构对垂直运输费用进行造价鉴定。

4. 特殊情形处理

   • 设计变更导致费用增加：若因发包人变更设计（如增加楼层、改变建筑布局）导致垂直运输难度或成本上升，承包人可依据《民法典》第803条主张增加费用。
     
   • 不可抗力或第三方原因：如因政府停工令、疫情导致设备闲置，需根据合同约定或公平原则分担损失。
     

建议：发生纠纷时，首先核查合同条款，其次收集设备使用记录、费用凭证等证据，必要时委托专业造价机构出具鉴定意见。若需进一步分析具体案情或起草法律文件，可直接向我咨询。