运输无效合同中价款的计算需根据无效原因及法律后果综合判定，核心结论如下：

1. 合同因违反法律强制性规定无效（如无资质运输、违禁品运输）
   根据《民法典》第157条，合同无效后，因该合同取得的财产应当返还；不能返还或没有必要返还的，应当折价补偿。

   • 价款处理：若运输行为未完成，托运方已支付的运费应全额返还；若运输已完成但合同违法（如运输违禁品），承运方可能需返还全部运费，甚至承担行政处罚责任。
     
   • 例外情形：若承运方已实际投入成本（如燃油、人力），法院可能根据公平原则，判决托运方补偿合理成本，但需扣除违法所得部分。

2. 合同因欺诈、胁迫或显失公平被撤销
   根据《民法典》第148-151条，受损害方有权请求撤销合同，合同被撤销后效力等同于无效。

   • 价款处理：若运输已完成，承运方可主张按实际运输成本（如市场价）要求补偿，但需举证证明成本合理性；若运输未完成，已收运费应全额返还。
     
   • 关键点：需区分“可撤销”与“无效”的后果差异，前者可能涉及过错方赔偿损失（如欺诈方赔偿对方信赖利益损失）。

3. 合同部分条款无效（如价款约定显失公平）
   根据《民法典》第156条，部分无效不影响其他部分效力的，其他部分仍有效。

   • 价款处理：若仅价款条款显失公平（如远低于市场价），法院可能参照市场标准调整价款；若其他条款（如运输路线、时间）合法，则按有效条款执行。
     
   • 举证责任：主张价款显失公平的一方需证明市场合理价格范围。

实务建议：

• 运输合同无效后，双方应优先协商处理价款；协商不成，需及时固定证据（如运输单据、成本凭证），通过诉讼或仲裁解决。
  
• 若合同无效涉及第三方损失（如货物毁损），可能需承担连带赔偿责任，建议提前评估风险。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我说明，我将结合案例为您详细分析。