城管对商人扣车后是否还会罚款，需根据具体违法情形及执法程序综合判断，可能存在以下两种情况：

1. 扣车与罚款可同时适用
   若商人的违法行为同时满足《行政处罚法》及地方性法规中关于“扣押财物”和“罚款”的双重处罚条件，城管部门可依法同时实施两项措施。例如：

   • 无证经营且阻碍执法：根据《无证无照经营查处办法》第十三条，城管可扣押专门用于无证经营的车辆；若当事人存在暴力抗法等情节，还可依据《治安管理处罚法》第五十条并处罚款。
     
   • 车辆超载或污染道路：依据《城市道路管理条例》第四十二条，城管可扣押违法车辆并处以罚款，罚款标准通常与超载比例或污染面积挂钩。
     关键点：需存在两个独立违法事实，且法律明确规定可并处扣押与罚款。

2. 仅扣车或仅罚款
   若违法行为仅符合单一处罚条件，或法律明确规定“择一处罚”，则城管不会同时实施两项措施。例如：

   • 轻微占道经营：根据《城市市容和环境卫生管理条例》第三十六条，城管可责令改正并处警告或罚款，但无需扣押车辆（除非拒不改正）。
     
   • 车辆未按规定停放：若仅违反停车规定，城管通常仅贴罚单或拖移车辆，不额外罚款（除非涉及多次违法或阻碍交通）。
     关键点：需结合违法行为性质、情节及地方执法细则判断。

程序性要求：
无论扣车还是罚款，城管均需遵循《行政处罚法》规定的程序，包括：

• 出示执法证件；
  
• 告知当事人权利义务；
  
• 制作现场笔录；
  
• 扣押财物需出具清单并由当事人签字；
  
• 罚款需出具省级财政部门统一制发的票据。
  

建议：
若您认为城管处罚存在程序违法或事实认定错误（如扣车后未出具凭证、罚款金额超出法定标准），可依法申请行政复议或提起行政诉讼。具体操作需结合案情细节，如有疑问可直接向我咨询。