员工自动离职，用人单位应当马上结算并支付工资，不能以自动离职为由拒绝支付。这是基于劳动者为用人单位提供劳动后，即有权获得相应劳动报酬的基本原则。以下从不同角度为您详细分析：
一、工资支付的基本原则
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论员工是正常离职还是自动离职，只要其为公司提供了劳动，公司就有义务支付相应的工资。同时，《工资支付暂行规定》第九条也明确规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这进一步强调了工资支付与离职方式无关，而是基于劳动者的实际劳动付出。
二、特殊情况下的工资处理
自动离职造成损失：
- 若劳动者自动离职给用人单位造成直接经济损失，如未按规定办理工作交接导致公司业务受影响，用人单位可根据《工资支付暂行规定》第十六条，要求劳动者赔偿经济损失。但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 举例：假设员工月工资为5000元，因自动离职给公司造成1000元损失，公司最多只能从其工资中扣除1000元（即20%的限额），且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。若当地最低工资标准为2000元，则公司实际可扣除的金额为3000元（5000元-2000元）中的1000元，即最终支付员工4000元。
旷工解除条件：
- 在某些情况下，自动离职可能被视为旷工。当旷工行为符合用人单位规章制度中规定的解除劳动合同条件时，用人单位可以解除劳动合同，但仍需支付劳动者旷工前提供正常劳动应得的工资。
三、维权途径
若用人单位以自动离职为由拒绝支付工资，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 协商解决：首先尝试与用人单位进行协商，要求支付工资。
- 投诉举报：若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 劳动仲裁：作为更进一步的措施，劳动者还可以申请劳动仲裁，通过法律程序来解决争议。
- 法律诉讼：在必要时，劳动者也可以向法院提起诉讼，要求用人单位支付工资及可能的赔偿。
四、建议与提醒
- 保留证据：劳动者在离职前应尽可能保留好与工作相关的证据，如工作记录、考勤记录等，以便在维权时提供有力支持。
- 了解法规：劳动者应了解自己的权益和用人单位的义务，以便在遭遇不公时能够及时采取措施维护自己的合法权益。
- 及时行动：一旦发现用人单位存在拖欠工资等违法行为，劳动者应及时采取行动，避免超过法定时效而丧失维权机会。
总之，员工自动离职并不改变其获得劳动报酬的权利。用人单位应遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。劳动者在遇到工资支付问题时，也应依法维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。