关于便利店辞职后工资是否全部发清的问题，结论是：在正常情况下，辞职时工资应当全部结清，但具体是否全部发清会受到多种因素的影响。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律规定层面
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者在解除或终止劳动合同时，用人单位应当一次性付清劳动者的工资。这意味着，从法律角度讲，你辞职时，便利店作为用人单位，有义务将你的工资全部结清，包括基本工资、加班费、奖金等所有应得报酬。
二、实际操作层面
尽管法律有明确规定，但在实际操作中，是否全部发清工资还可能受到以下因素的影响：
工资结算周期：如果你的工资是按月结算，而你在月中辞职，那么便利店可能会按照你实际工作的天数来计算工资，并扣除相应的社保、公积金等个人承担部分后，将剩余工资发放给你。这种情况下，虽然不是全额发放整个月的工资，但也是按照实际工作天数进行了结算，符合法律规定。
未结清的奖金或提成：如果你在便利店工作期间有未结清的奖金或提成，这部分收入是否会在辞职时一并发放，可能取决于便利店的内部规定或你与便利店之间的约定。如果便利店规定或约定在辞职时一并结清，那么这部分收入也应当全部发放给你。
违约金或赔偿金：如果你在辞职过程中存在违反劳动合同或便利店规章制度的行为，便利店可能会要求你支付违约金或赔偿金。这部分费用可能会从你的工资中扣除。但需要注意的是，违约金或赔偿金的扣除必须符合法律规定和劳动合同的约定，不能随意扣除。
三、特殊情况处理
如果便利店在辞职时未全部发清你的工资，你可以采取以下措施：
与便利店协商：首先，你可以尝试与便利店进行协商，了解未发清工资的原因，并要求便利店尽快发放。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁：如果劳动监察部门无法解决问题，你还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
建议：在辞职前，最好与便利店明确工资结算方式和时间，并保留好相关证据（如工资条、劳动合同等），以便在出现问题时能够及时维护自己的权益。如果你在辞职过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。