针对您提出的“司机故意滞留厂里怎么处理”的问题，这确实是一个涉及劳动权益与用人单位管理权的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，司机作为劳动者，享有劳动权和获得劳动报酬的权利，这是由《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》所保障的。同时，用人单位也有权根据规章制度对员工的违规违纪行为进行处罚，但这种处罚必须合理合法，不得侵害劳动者的基本权利。

针对司机故意滞留厂里的情况，用人单位应当首先了解滞留的具体原因。如果是因为司机对某些安排或待遇不满而采取的极端行为，用人单位应当积极与司机进行沟通，了解其诉求，并尝试通过协商解决问题。沟通是化解矛盾的关键，通过坦诚的交流，往往能够找到双方都能接受的解决方案。

如果沟通无果，且司机的滞留行为已经严重影响了厂里的正常生产秩序，用人单位可以考虑依据规章制度对司机进行处罚。但处罚措施必须合理合法，不能过度侵害司机的劳动权和获得劳动报酬的权利。例如，可以采取警告、罚款（但需注意，根据一些地方法规，如《广东省劳动保障监察条例》，用人单位的规章制度规定的罚款内容或者对劳动者实施罚款、扣减劳动者工资没有法律、法规依据的，可能会受到行政处罚）、停工培训（但停工期间应支付合理的劳动报酬，不能以最低工资标准或更低的标准来变相降低）等措施。

然而，在采取处罚措施时，用人单位必须谨慎行事。因为一旦处罚措施被认定为不合理或违法，不仅可能面临法律纠纷，还可能对用人单位的声誉和劳动关系造成负面影响。例如，如果处罚措施被认定为侵害了司机的劳动权或获得劳动报酬的权利，司机可能会提出解除劳动合同并要求经济补偿，如参考信息中的案例所示。

因此，我建议用人单位在处理此类情况时，应当：

1. 积极沟通：与司机进行坦诚的交流，了解其滞留的具体原因和诉求，尝试通过协商解决问题。
2. 依法依规：依据公司的规章制度和法律法规对司机的行为进行评估，确保处罚措施合理合法。
3. 谨慎处罚：在采取处罚措施时，要充分考虑处罚的严重程度与司机违规行为的匹配性，避免过度处罚。
4. 寻求法律支持：如果情况复杂或难以处理，建议寻求法律专业人士的支持和帮助，以确保处理方式的合法性和有效性。

总之，处理司机故意滞留厂里的问题需要用人单位在保障劳动者权益的同时，也依法行使管理权。通过积极沟通、依法依规、谨慎处罚和寻求法律支持等方式，可以更有效地解决此类问题，维护和谐的劳动关系。