针对您提出的“公司用规章制度对员工罚款怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
在我国现行法律框架下，公司一般不能对员工进行直接罚款，但可以在合法、合理的范围内，通过规章制度设定一定的经济处罚措施（如扣款），且这些措施需确保不违反法律法规的强制性规定。接下来，我将从法律层面、公司规章制度角度以及管理措施建议三个方面，为您详细阐述如何处理这一问题。
一、法律层面分析
一般情况：
- 根据《中华人民共和国劳动法》，用人单位应依法建立和完善规章制度，但这些规章制度主要用于规范管理和引导员工行为，并未直接赋予用人单位罚款的权利。
- 《中华人民共和国行政处罚法》也明确规定，除法律、法规、规章外，其他规范性文件不得设定行政处罚。因此，企业无权对员工进行罚款。
特殊情况：
- 如果员工因故意或重大过失给公司造成了直接经济损失，公司可以依据劳动合同和相关法律规定要求员工进行赔偿。这种赔偿并非罚款，而是基于员工过错行为给企业造成实际损失的一种补偿。
- 赔偿金额应与实际损失相符，且每月扣除的赔偿金额不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
二、公司规章制度角度分析
规章制度的合法性：
- 公司的规章制度必须经过民主程序制定，内容不违反法律法规的强制性规定，并已向员工公示或告知。
- 在规章制度中，可以合理设定一些经济处罚措施（如扣款），但这种扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
合理性判断：
- 罚款或扣款的金额应当合理，不应明显超出员工违纪行为可能造成的影响或损失。
- 如果罚款金额过高或导致员工工资收入过低，影响其正常生活，这样的规定可能会被认定为不合理，从而不具有法律效力。
三、管理措施建议
完善规章制度：
- 确保规章制度内容合法合理，罚款金额和情形需与员工过错程度相匹配。
- 规章制度需经民主程序制定，并公示告知员工，确保员工了解并遵守。
明确可扣除工资的情形：
- 员工因故意或重大过失造成公司经济损失时，企业可要求赔偿，但需遵守每月扣除工资不得超过当月工资20%的规定。
- 企业可依法从员工工资中代扣个人所得税、社会保险费等法定费用。
确保罚款程序的公正性：
- 及时记录员工违纪事实，采用书面报告、考勤记录等方式固定证据。
- 在处理前，将违纪事实和拟采取的措施告知员工，给予其申辩机会。
合理的罚款额度与执行方式：
- 罚款金额应合理设定，符合法律法规及行业惯例。
- 执行方式应明确，通常通过工资扣除进行，确保操作合法合规。
加强沟通与教育：
- 罚款实施后，及时与员工沟通，了解其看法和意见。
- 借此机会进行再教育和引导，帮助员工认识错误并改正行为。
四、劳动者权益保护
- 如果劳动者遇到公司以罚款名义恶意扣工资的行为，可向劳动行政部门投诉，由劳动行政部门责令公司支付工资和经济补偿，并可责令支付赔偿金。
- 劳动者还可向劳动争议仲裁机关申请仲裁，不服仲裁裁决时，可进一步向人民法院提起诉讼。
综上所述，公司在管理员工时应严格遵守法律法规，确保规章制度的合法性和合理性。对于员工的违规行为，应采取合法、合理的管理措施，并尊重劳动者的合法权益。通过完善规章制度、明确可扣除工资的情形、确保罚款程序的公正性、设定合理的罚款额度与执行方式以及加强沟通与教育等措施，公司可以既维护自身秩序，又保障员工权益，实现企业与员工的和谐共赢。