结论：公司不能随意以体检不合格为由单方面拒绝您入职，除非能证明该体检不合格状况会直接影响到您的工作表现、公共安全，或该状况违反了劳动合同的明确约定及法律法规的强制性规定。
详细分析：
劳动合同的效力：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十六条，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经双方在劳动合同文本上签字或者盖章生效。一旦签订了劳动合同，双方就应履行各自义务。公司若以体检不合格为由拒绝您入职，可能构成违约，除非其能证明体检不合格与岗位要求有直接关联，且在录用条件中有明确约定。
公司解除劳动合同的法定情形：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定了用人单位可以解除劳动合同的情形，包括在试用期间被证明不符合录用条件的等。但体检不合格并不直接等同于不符合录用条件。公司需证明体检不合格会直接影响您的工作表现或公共安全，且该标准已在招聘时明确告知您。
公司知情权的边界：
- 用人单位有权了解与劳动合同直接相关的劳动者基本情况，包括必要的身体情况。但知情权有边界，禁止进行歧视性体检。如公司以歧视性体检结果为由拒绝您入职，则违法。
劳动者权益与应对措施：
了解自身权益：
- 您有权要求公司提供详细的体检报告和不合格的依据。如公司无法提供合理解释或证明，您有权要求继续履行合同或寻求法律救济。
与公司协商：
- 尝试与公司沟通，了解拒绝入职的具体原因和依据。可协商达成双方都能接受的解决方案，如调整工作岗位、提供治疗期等。
保留证据并寻求法律援助：
- 保留好相关证据，如劳动合同、体检报告、沟通记录、上班证据（如打卡记录、工作记录）等。如协商无果，可向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，甚至向法院提起诉讼。
注意时效问题：
- 提起仲裁或诉讼需在法定时效内进行，以免错过维权时机。
特殊情况：
- 如果合同中明确约定即使体检不合格也不影响入职，或者体检项目与工作岗位并无实质关联（如非基于工作性质所必需，且不涉及公共安全、健康等重要因素），那么您有可能主张自己已经正式入职。
公司可能承担的法律后果：
若劳动仲裁机构或法院认定公司行为构成违法解除劳动合同，根据相关规定，公司可能需要按经济补偿标准的二倍向您支付赔偿金。同时，公司行为还可能违反劳动法律法规的相关规定，劳动行政部门有权责令改正，并可处以罚款等处罚措施。
综上所述，公司在已签订劳动合同并允许您上班后，不能仅以体检不合格为由拒绝您入职。您应了解自己的权益，积极与公司协商，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。