结论前置：公司要求员工返还其已承担的社保和公积金全部费用，一般不合法，但存在特殊情况需具体分析。以下分情况详细说明：

1. 正常补缴情形下，公司要求员工返还费用不合法

根据《社会保险法》和《住房公积金管理条例》，社保和公积金的缴纳义务由用人单位和劳动者共同承担：

• 社保：养老保险、医疗保险、失业保险由单位和个人按比例缴纳（工伤保险、生育保险由单位单独缴纳）；
• 公积金：单位和个人按相同比例缴纳（最低比例各5%，最高各12%）。

若公司因未依法缴纳社保和公积金而补缴，补缴的金额应由单位和个人按法定比例各自承担。例如：

• 补缴时，单位需承担单位应缴部分（如养老保险16%、医疗保险8%等），同时代扣代缴个人应缴部分（如养老保险8%、医疗保险2%等）；
• 若公司已为员工代缴了个人应承担的部分，公司无权要求员工返还，因为这是员工的法定义务。

法律依据：

• 《社会保险法》第六十条：“职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。”
• 《住房公积金管理条例》第十九条：“职工个人缴存的住房公积金，由所在单位每月从其工资中代扣代缴。”

2. 特殊情形：公司垫付个人部分后，可要求员工返还

若公司因以下原因先行垫付了员工个人应缴的社保和公积金费用，且员工同意或事后认可，公司可要求员工返还：

• 员工无力支付：如员工因经济困难无法承担个人部分，公司出于人文关怀先行垫付；
• 公司操作失误：如公司误将全部费用（单位+个人）计入单位账户，后续要求员工补缴个人部分；
• 双方约定：如劳动合同或补充协议中明确约定，公司可代缴个人部分并从工资中扣除。

但需满足以下条件：

• 公司需提供垫付的证据（如缴费凭证、员工签字确认的协议等）；
• 返还金额不得超过员工实际应承担的部分；
• 返还方式需合法（如从工资中扣除时，需符合《工资支付暂行规定》关于扣款比例的限制）。

3. 公司要求返还全部费用（含单位部分）的合法性分析

若公司要求员工返还包括单位应缴部分在内的全部费用，则明显违法，原因如下：

• 单位应缴部分是公司的法定义务，与员工无关；
• 员工无义务为公司的违法行为（如未依法缴纳社保）买单；
• 此类要求可能涉嫌变相克扣工资，违反《劳动法》第五十条。

建议

1. 对员工：若公司要求返还费用，可要求公司出示缴费明细和法律依据，核实返还金额是否合理；若公司强行扣款，可向当地社保部门、公积金中心或劳动监察大队投诉。
2. 对公司：应依法履行缴费义务，避免因补缴问题引发劳动纠纷；若需员工承担个人部分，应通过合法途径（如工资代扣）实现，并保留相关证据。

如有进一步疑问，可直接向我咨询。