在建设工程施工合同仲裁过程中，是可以申请对工程量进行鉴定的。这一做法在法律上有明确的依据，并且在实践中也是解决工程量争议的有效手段。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据与重要性

根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第三十二条，对于工程造价、质量等专门性问题存在争议时，人民法院（在仲裁程序中，仲裁机构同样可以参照此精神）可依据需要指定司法鉴定。工程量作为造价的基础，其准确性对于解决纠纷至关重要。因此，在合同约定不明、工程变更复杂或缺乏有效计量凭证等情形下，通过司法鉴定来确定工程量，是维护当事人合法权益的重要途径。

二、具体适用情形

1. 合同约定不明：当合同对工程量的计算方式、范围等未明确约定时，仲裁机构可以依据行业规范和实际施工情况，通过司法鉴定来确定工程量。
2. 工程变更复杂：因设计变更、业主需求变化等原因导致的工程量变更争议，仲裁机构可以委托司法鉴定机构依据施工图纸、变更通知等资料进行专业鉴定。
3. 缺乏有效计量凭证：若因管理不善或资料缺失导致无法准确计量工程量，仲裁机构同样可以委托司法鉴定机构通过现场勘查和技术分析来合理推断工程量。

三、仲裁过程中的鉴定流程

虽然仲裁程序与诉讼程序在细节上可能有所不同，但关于工程量鉴定的基本流程是相似的。一般来说，包括以下几个步骤：

1. 提出申请：当事人向仲裁机构提出对工程量进行鉴定的申请，并提交相关证据材料。
2. 委托鉴定：仲裁机构审查申请后，决定是否委托有资质的司法鉴定机构进行鉴定。
3. 鉴定实施：鉴定机构进行现场勘查、收集证据、听取陈述等工作，确保鉴定的全面性和准确性。
4. 出具鉴定意见：鉴定机构出具鉴定意见，明确工程量及其计算依据和理由。
5. 质证与采信：当事人对鉴定意见进行质证，仲裁机构根据质证情况审查和采信鉴定意见。

四、注意事项与特殊情况

1. 选择资质机构：确保鉴定机构的权威性和公正性，是保障鉴定结果有效性的关键。当事人应选择具有相应资质和经验的鉴定机构进行鉴定。
2. 仲裁成本与时间：司法鉴定涉及专业问题，可能增加仲裁时间和成本。双方应充分考虑并尽量协商解决争议，以降低仲裁成本和时间。
3. 异议处理：对鉴定结果有异议时，当事人可以向仲裁机构提出重新鉴定的申请或搜集其他证据推翻结论。仲裁机构将根据具体情况决定是否重新鉴定或采纳其他证据。
4. 特殊情况处理：在固定总价合同且未约定变更工程量或价格的情况下，仲裁机构可能不会接受鉴定申请。但在固定单价合同或对工程量有争议的情况下，仲裁机构通常会对工程量进行鉴定。此外，如果仅部分工程量有争议，仲裁机构可能仅对有争议部分进行鉴定；但如果鉴定机构认为需要全面反映争议事项，则可能对全部工程进行鉴定。

综上所述，在建设工程施工合同仲裁过程中申请对工程量进行鉴定是合法且有效的。如果你在仲裁过程中遇到工程量争议问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。