当股东会议中有股东不来参加时，公司可以采取以下一系列措施来确保会议的顺利进行和决议的有效性，同时充分尊重并保护股东的权益：
一、会议前的准备与沟通
正式通知：
- 公司应严格按照公司章程规定的时间和方式，向所有股东发送股东会通知。通知中应明确会议的时间、地点、议程等重要信息，并确认股东是否参加。
- 若未得到股东的回应，公司可以在适当的时间再次提醒，以确保股东收到并了解会议信息。
私下沟通：
- 安排公司管理层或其他股东与缺席股东进行私下交流，了解其不参加会议的具体原因。
- 尝试通过沟通解决可能的误解或异议，争取缺席股东的支持和参与，同时对会议议题进行提前解释和沟通。
二、会议召开的合法性
法定人数检查：
- 根据《公司法》和公司章程的规定，检查出席会议的股东人数或所持表决权是否达到法定要求。只要满足条件，会议即可正常召开。
会议有效性确认：
- 确保股东会的召集程序、表决方式等均符合法律、法规和公司章程的规定。
- 记录会议的召集、通知、出席情况、表决过程等关键信息，以证明会议的有效性。
三、决议的形成与执行
表决与决议：
- 对于一般事项，经出席会议的股东所持表决权过半数通过即可形成决议。
- 对于重大事项（如修改公司章程、增减注册资本、公司合并分立等），则需三分之二以上表决权通过。
- 若缺席股东既未亲自出席也未委托代理人出席，可以视为其对此次会议的表决事项弃权。
记录与公告：
- 无论股东是否出席，公司都应如实记录股东会的讨论内容和表决结果。
- 形成正式的会议决议，并按照公司章程规定进行公告或通知所有股东。
执行与监督：
- 缺席股东不影响决议的执行。公司应按决议积极推进工作，并监督执行情况。
- 如有必要，可将执行情况反馈给所有股东，以增强透明度和信任。
四、大股东或长期缺席股东的特殊处理
决策中的考量：
- 在涉及利润分配、增资扩股等重大事项时，应确保决策不会损害缺席股东的合法权益。
- 若缺席股东为大股东，其长期不参加可能影响公司决策和运营，公司应主动沟通了解原因，并尝试寻求解决方案。
法律途径解决争议：
- 若缺席股东对决议有异议或认为权益受损，可通过法律途径寻求救济，如向人民法院提起诉讼。
- 公司应准备好相关证据，证明股东会的召集、表决等程序符合法律和公司章程的规定。
特殊措施：
- 在遵循公司章程和相关法律法规的前提下，公司可以考虑采取如增资扩股方式对其股权比例进行稀释等措施（但需注意不得损害其他股东的合法权益）。
- 若缺席股东长期不参加且无法通过沟通解决问题，其他股东可根据公司章程或法律规定采取进一步措施，如要求其转让股权或提起股东代表诉讼。
五、委托代理人出席
- 根据《公司法》的规定，股东可以委托代理人出席股东大会会议并代为行使表决权。
- 若股东因故无法亲自参加会议，可以考虑委托其他股东或专业人士作为代理人出席会议。
综上所述，当股东会议中有股东不来参加时，公司应综合运用沟通协商、确保会议合法性、形成并执行决议、特殊处理以及委托代理人出席等多种方式来解决问题。这些措施旨在确保公司的正常运营和股东权益的保护，同时促进股东间的信任和理解。