结论：休年假在第二年休完后离职，工资的发放情况主要取决于年假的性质以及离职的具体原因，一般情况下，正常离职且年假已休完，工资会正常发放；若因用人单位违法行为离职，除工资外还可能主张经济补偿。以下为详细分析：
一、年假性质与工资发放
法定年假：
- 根据《职工带薪年休假条例》，职工在连续工作满一定年限后，享有带薪年休假。若您在离职前已经休完了第二年的法定年假，且离职是出于个人原因（如自愿离职、找到新工作等），那么您的工资应当按照正常离职流程进行结算，即包括您已工作期间的工资以及可能享有的其他福利待遇（如奖金、提成等，具体依据公司规章制度和劳动合同约定）。
公司福利年假：
- 有些公司除了法定年假外，还会提供额外的福利年假。若您休的是公司福利年假，且离职时已经休完，同样地，您的工资也会按照正常离职流程进行结算。但需要注意的是，公司福利年假的具体规定可能因公司而异，因此最好查阅您所在公司的员工手册或劳动合同以获取准确信息。
二、离职原因与工资及经济补偿
正常离职：
- 若您因个人原因（如自愿离职、家庭原因等）提出离职，且已经休完了第二年的年假，那么您的工资将按照正常离职流程进行结算，即包括您已工作期间的工资以及可能享有的其他福利待遇。在此情况下，您通常无权要求用人单位支付额外的经济补偿。
因用人单位违法行为离职：
- 若您因用人单位存在违法行为（如未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等）而提出离职，且已经休完了第二年的年假，那么您除了有权要求用人单位按照正常离职流程结算工资外，还有权依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，要求用人单位支付经济补偿。
- 经济补偿的计算方式依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，即按照您在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向您支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向您支付半个月工资的经济补偿。
三、建议与注意事项
- 在离职前，建议您与用人单位就工资结算、年假补偿（如有）以及经济补偿（如适用）等问题进行明确沟通，并保留好相关证据（如劳动合同、工资条、离职证明等），以备不时之需。
- 若您对用人单位的工资结算或经济补偿方案有异议，可以依法向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
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