企业设立登记的行政许可制定主体为国务院或省级人民政府，具体依据企业类型及行业特殊性而定。以下从不同角度展开分析：

1. 一般企业设立登记的行政许可制定主体
   根据《中华人民共和国行政许可法》第十二条、第十四条、第十五条的规定，企业设立登记的行政许可通常由国务院制定。国务院通过发布行政法规（如《中华人民共和国公司登记管理条例》）或决定的形式，设定企业设立登记的行政许可事项。此类许可适用于大多数普通企业的设立登记，旨在规范市场秩序，保障交易安全。

2. 地方性企业设立登记的行政许可制定主体
   在特定情况下，省级人民政府也可根据地方性法规设定企业设立登记的行政许可。此类许可通常针对地方特色产业或需特殊管理的行业，如某些地方对特定行业的准入条件、经营范围等作出额外规定。但需注意，省级人民政府设定的行政许可不得违反上位法（如《行政许可法》及国务院制定的行政法规），且不得限制其他地区的个人或企业到本地区从事生产经营活动。

3. 特殊行业企业设立登记的行政许可制定主体
   对于涉及国家安全、公共利益或需特殊资质的行业（如金融、电信、能源等），企业设立登记的行政许可可能由国务院行业主管部门制定具体实施细则。此类许可通常以部门规章或规范性文件的形式发布，旨在加强行业监管，确保企业具备从事特定业务的资质和能力。例如，商业银行的设立需经中国银保监会批准，证券公司的设立需经中国证监会批准。

总结：企业设立登记的行政许可制定主体具有多层次性，一般由国务院制定，地方性许可由省级人民政府制定，特殊行业许可可能由国务院行业主管部门制定具体实施细则。若您在企业设立登记过程中遇到具体法律问题，可直接向我咨询。