当营运车辆的保险公司不赔偿停运期间的损失时，您可以按照以下详细步骤来处理这一问题：
一、明确保险条款与责任范围
查阅保险合同：
- 仔细审查您与保险公司签订的保险合同，特别是关于赔偿责任和免责条款的部分。
- 确认停运损失费是否明确列在保险责任范围内，以及是否存在任何可能导致保险公司免责的情形。
了解法律规定：
- 根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人有权请求侵权人赔偿。
- 但具体是否由保险公司承担赔偿责任，需严格依据保险合同条款来判断。
二、与保险公司沟通协商
联系保险公司：
- 在确认停运损失费属于保险责任范围后，及时联系保险公司的理赔部门。
- 说明您的具体情况，并提供相关证据材料，如事故认定书、维修记录等。
协商解决方案：
- 尝试与保险公司就停运损失费的赔偿问题进行友好协商。
- 寻求一个双方都能接受的解决方案，如部分赔偿或分期赔偿等。
三、采取法律手段维护权益
收集证据：
- 如果保险公司仍然拒绝赔偿，您需要开始收集相关证据来证明停运损失的实际发生和金额。
- 证据可能包括事故认定书、维修记录、收入证明（如银行流水、税务申报记录）、租赁合同（如适用）等。
咨询专业律师：
- 考虑聘请一位专业的交通事故或保险纠纷律师，他们可以提供更具体的法律建议和指导。
- 律师可以帮助您评估胜诉的可能性及诉讼成本，并为您制定合适的诉讼策略。
提起诉讼：
- 在律师认为证据充分且胜诉可能性较大的情况下，您可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
- 要求保险公司赔偿停运损失费，并务必遵守法院的程序规定，如按时提交证据、参加庭审等。
四、注意事项
保留所有相关文件和通信记录：
- 这些文件可能在后续的协商或诉讼中起到关键作用，因此务必妥善保管。
注意诉讼时效：
- 根据法律规定，民事权利的诉讼时效期间通常为三年。
- 您需要在规定的时效期间内提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
五、额外建议
投保前确认条款：
- 在购买车险时，务必仔细阅读条款，特别是免责事项和赔偿范围。
- 如有需要，可向保险公司咨询是否提供停运损失险等特殊险种。
保留证据意识：
- 发生事故后，及时收集并保留所有与停运损失相关的证据，以便后续索赔。
灵活应对协商与诉讼：
- 在协商过程中，保持灵活和开放的态度，尝试寻求双方都能接受的解决方案。
- 如果协商不成，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。
综上所述，当营运车辆的保险公司不赔偿停运期间的损失时，您可以通过明确保险条款、与保险公司沟通协商、采取法律手段维护权益以及注意相关事项等步骤来处理这一问题。希望这些建议能对您有所帮助。