以押金抵工程款是否有效合法，需根据具体情况来判断，主要取决于双方之间的协议及真实意愿。以下是对此问题的详细分析：
合法的情况
双方协商一致：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。若双方（即押金收取方与工程款支付方）在工程款结算时，协商一致同意将押金用于抵扣工程款，则该行为合法有效。
- 实例说明：在工程结束后，双方经过友好协商，认为用押金抵扣部分工程款既方便又合理，于是达成一致意见，此时抵扣行为受法律保护。
有相关约定：
- 如果双方在签订工程合同或相关协议时，明确规定了押金在特定条件下可以抵扣工程款，那么该约定具有法律约束力。当满足约定条件时（如工程验收合格、无违约行为等），押金抵扣工程款的行为是合法的。
- 实例说明：双方在合同中约定，若工程按时完成且质量达标，则押金可全额抵扣工程款。在工程满足条件后，押金抵扣工程款的行为即符合合同约定，合法有效。
不合法的情况
未经对方同意：
- 若一方未经另一方同意，擅自将押金抵作工程款，则违反了自愿原则，可能构成违约或侵权。此时，另一方有权要求返还押金或采取其他法律措施维护自身权益。
- 实例说明：在工程结束后，一方未经另一方同意，直接将押金抵扣了部分工程款。此时，另一方可以依据合同或相关法律规定，要求返还押金或要求支付全额工程款。
不符合约定条件：
- 如果双方协议中对押金抵扣工程款设定了特定条件，而实际情况并未满足这些条件，一方仍进行抵扣，则违反了协议约定。此时，另一方有权依据协议要求纠正抵扣行为或要求赔偿损失。
- 实例说明：双方在合同中约定，押金需在工程验收合格后才能抵扣工程款。但工程在验收前，一方就擅自将押金抵扣了部分工程款。此时，另一方可以依据合同约定，要求返还押金或要求支付全额工程款，并可能要求赔偿因违约造成的损失。
法律建议
- 明确约定：为避免纠纷，双方在签订工程合同或相关协议时，应明确约定押金的性质、用途、抵扣条件及方式等条款。
- 协商一致：在工程款结算时，双方应充分沟通、协商一致，确保押金抵扣工程款的行为符合双方的真实意愿和合同约定。
- 保留证据：双方应妥善保管与押金抵扣工程款相关的证据材料（如合同、协议、结算单等），以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
综上所述，以押金抵工程款是否有效合法，需根据双方之间的协议及真实意愿来判断。为确保自身权益，双方在签订相关协议时应仔细阅读条款内容，明确押金的用途及抵扣条件。同时，在工程款结算时，双方应充分沟通、协商一致，确保抵扣行为合法有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。