结论：经侦确定虚开后，税务部门是否还会按偷逃税款处理，需根据具体情况判断，若虚开行为同时构成偷逃税款，税务部门会依法处理；若不构成，则不会按偷逃税款处理。以下为详细分析：

一、虚开与偷逃税款的关系

虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，与偷逃税款是两种不同的违法行为，但二者之间可能存在关联。虚开行为可能直接导致国家税款的流失，若虚开的目的或结果是为了偷逃税款，那么该行为就同时构成了偷逃税款。然而，并非所有的虚开行为都必然导致偷逃税款，有些虚开行为可能是出于其他目的，如虚增业绩、骗取贷款等。

二、税务部门的处理原则

1. 独立调查与认定：税务部门在处理税收违法行为时，会依据自身的调查和认定结果，独立于经侦部门的调查。即使经侦部门已经确定了虚开行为，税务部门仍需根据自身的调查结果，判断该行为是否同时构成了偷逃税款。

2. 依法处理：若税务部门认定虚开行为同时构成了偷逃税款，那么将依法对纳税人进行税务处理，包括追缴税款、加收滞纳金、罚款等。若虚开行为未构成偷逃税款，但违反了其他税收法律法规，税务部门也将依法进行相应处理。

三、具体情形分析

1. 虚开且偷逃税款：

   • 在这种情况下，纳税人不仅虚开了发票，还通过虚开行为偷逃了税款。税务部门在发现后，将依法对纳税人进行税务处理，包括追缴偷逃的税款、加收滞纳金，并可能处以罚款。同时，若虚开行为情节严重，还可能构成犯罪，需承担刑事责任。

2. 虚开但未偷逃税款：

   • 在这种情况下，纳税人虽然虚开了发票，但并未通过虚开行为偷逃税款。税务部门在发现后，将根据虚开的具体情况，如虚开的金额、次数等，依法对纳税人进行税务处理，如罚款等。但此时，税务部门不会按偷逃税款对纳税人进行处理。

四、法律建议

1. 合规经营：纳税人应严格遵守税收法律法规，避免虚开发票等违法行为的发生。合规经营是降低税收风险、维护企业声誉和长期发展的基础。

2. 及时自查与整改：若纳税人发现自己存在虚开发票等违法行为，应及时进行自查和整改，主动向税务部门报告并配合调查。这有助于减轻或避免税务部门的处罚，并降低企业的法律风险。

3. 寻求专业帮助：若纳税人对税收法律法规或税务处理存在疑问或困惑，应及时寻求专业律师或税务师的帮助。他们可以提供专业的法律意见和税务筹划建议，帮助纳税人更好地理解和应对税收问题。

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