劳动仲裁后补付的工资，其个税扣缴方式与正常工资薪金一致，但需根据补付工资所属期间进行区分处理。具体分析如下：

1. 补付工资属于同一纳税年度的
   若补付的工资属于当前纳税年度内（如当年1月至12月），用人单位应将其并入当月工资薪金总额，按照“工资、薪金所得”项目，以累计收入减除累计免税收入、累计减除费用、累计专项扣除、累计专项附加扣除和累计依法确定的其他扣除后的余额，计算应纳税额。简单来说，就是与当月工资合并计税，适用超额累进税率（3%-45%）。

2. 补付工资属于以前纳税年度的
   若补付的工资属于以前纳税年度（如补发上一年度工资），根据《个人所得税法》及实施条例，纳税人需在取得收入的次月15日内，向税务机关办理纳税申报。此时有两种处理方式：

   • 并入综合所得计税：若纳税人选择并入综合所得（工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得），需在次年3月1日至6月30日内办理汇算清缴，多退少补。
     
   • 单独计税（特殊情况）：若符合《财政部 税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》中的特殊规定（如一次性补偿收入等），可单独计税，但补付工资通常不适用此情形。
     

实务建议：

• 用人单位在补付工资时，应主动代扣代缴个税，并向员工提供完税证明。
  
• 若补付金额较大，建议员工提前规划税务，避免因税率跳档导致实际到手收入减少。
  
• 如有争议（如补付工资性质认定、计税方式选择等），可直接向我咨询，我会结合具体案情提供解决方案。