在综合工时制下，如果劳动者未满工作时间，其工资及加班情况的计算需遵循特定的规则和标准。以下是对这一问题的详细解答：

一、综合工时制下未满工作时间的工资计算

在综合计算工时工作制下，劳动者的工资计算通常基于其实际工作时间与约定的综合计算周期内的总工作时间来对比。若劳动者在综合计算周期内的实际工作时间未达到该周期的总法定标准工作时间，那么其工资一般按照正常工作时间工资来支付，即不会因未满工作时间而扣减工资（除非劳动合同或公司规章制度中有特别约定，且该约定不违反法律法规）。

二、加班情况的界定与计算

1. 平时加班：

   • 若劳动者在综合计算周期内的实际工作时间总数超过了该周期的法定标准工作时间总数，超出部分即被视为延长工作时间，也就是平时加班。
   • 加班工资应按不低于劳动者本人小时工资标准的150%来支付。具体计算方式为：超出的小时数乘以小时工资再乘以150%。

2. 休息日加班：

   • 在综合工时制下，休息日并非固定为周六周日，而是根据综合计算周期来确定的非工作日。
   • 若劳动者在休息日工作，且不能安排补休的，应按照不低于劳动者本人小时工资标准的200%支付加班工资。

3. 法定节假日加班：

   • 无论综合计算周期内的总工作时间是否超过法定标准工作时间，只要劳动者在法定节假日工作，都应按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。
   • 法定节假日的加班工资不能通过补休来替代。

三、加班时长限制与综合计算周期内的总工作时间

• 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工在正常工作周期以外的延长期限内工作的小时数，平均每月累计不得超过36小时。这是为了保护劳动者的休息权益。
• 综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。例如，在年综合计算周期下，劳动者的标准年工时和可允许的加班小时数总和有明确的上限。

四、特别提醒

• 实行综合计算工时工作制需要经过劳动行政部门的审批，用人单位不能自行决定。
• 用人单位应确保劳动者的休息休假权利得到保障，即使采用综合计算工时制，平均日工作时间和平均周工作时间也应与法定标准工作时间基本相同。
• 用人单位应建立健全的加班管理制度，合理安排工作时间，避免过度加班，以维护劳动者的身心健康和工作积极性。

综上所述，在综合工时制下，如果劳动者未满工作时间，其工资一般按照正常工作时间工资来支付。而加班工资的计算则需根据加班时间（平时、休息日、法定节假日）和加班工资计算基数来确定，并应遵守加班时长限制和综合计算周期内的总工作时间规定。