结论：法院将原告自己虚开发票的税款判由被告支付，一般情况下是不合法的，但需结合具体案情判断是否存在例外情形。以下分情况详细说明：

1. 虚开发票行为的法律定性

根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，虚开发票包括为他人、为自己、介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票，或让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票。虚开发票属于违法行为，可能涉及行政处罚（如罚款、没收违法所得）或刑事责任（如虚开增值税专用发票罪）。

关键点：虚开发票的税款本身不具有合法性，法院通常不会支持通过违法行为产生的利益诉求。若原告虚开发票的目的是为了非法获取税款利益（如骗取出口退税、抵扣税款等），其主张的税款支付请求可能因缺乏合法性基础被驳回。

2. 法院判决的合法性分析

• 一般情况：若原告虚开发票的行为已被税务机关或司法机关认定违法，且税款本身属于非法利益，法院将该税款判由被告支付缺乏法律依据，可能违反“不得以违法行为获利”的司法原则。
• 例外情形：若存在以下情况，法院可能支持部分或全部判决：
  • 被告存在过错：例如被告明知原告虚开发票仍接受并使用，导致税款损失扩大，法院可能根据过错比例判令被告承担部分责任；
  • 合同约定：若双方合同中明确约定税款承担方式（如“含税价”），且被告未履行合同义务导致原告虚开发票，法院可能结合合同履行情况判决；
  • 表见代理或善意取得：若被告有理由相信原告开具发票的行为合法（如原告具备开具发票的资质），且被告已实际使用发票，法院可能酌情判决被告承担部分税款，但需严格审查证据。

3. 被告的救济途径

若被告认为法院判决错误，可依法通过以下途径维权：

• 上诉：在判决书送达之日起十五日内向上一级法院提起上诉，主张原告虚开发票的行为违法，税款不应由己方承担；
• 申请再审：若判决已生效，发现新证据或原判决适用法律错误，可向法院申请再审；
• 举报违法行为：向税务机关举报原告虚开发票的行为，税务机关查实后可能对原告进行处罚，并影响原判决的执行。

4. 实务建议

• 对原告：虚开发票不仅可能面临行政处罚或刑事责任，其主张的税款支付请求也可能因违法性被驳回，建议诚信经营，避免违法行为。
• 对被告：收到法院判决后，应仔细审查原告开具发票的合法性，若发现虚开情形，及时提出抗辩并收集证据（如税务机关认定文件、合同条款等），必要时咨询专业律师。

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