当您在取保候审期间手机被扣押时，这通常意味着手机可能与案件有关，其内存储的电子数据可能作为证明案件事实的证据。面对这种情况，您可以按照以下步骤来合理处理，并保障自己的合法权益：
一、了解扣押原因与法律依据
询问扣押原因：首先，您应向办案机关询问扣押手机的具体原因，要求其说明手机与案件的关联性。这有助于您理解扣押的必要性，并为后续处理提供依据。
了解法律依据：根据《刑事诉讼法》第一百四十一条，侦查人员有权在勘验、搜查中查封、扣押与案件有关的财物、文件。若手机属于涉案证据或可能妨碍诉讼活动，公安机关可依法扣押。
二、确认扣押程序是否合法
核查手续：要求办案机关出示《扣押决定书》或相关法律文书，明确扣押的依据和期限。这是确保扣押行为合法性的重要步骤。
权利告知：扣押时应制作清单并由您签字确认，同时告知您申请取回的权利及途径。若未履行上述程序，您有权向办案单位提出异议。
三、申请取回手机
提交书面申请：在案件查清后或检察院审查起诉时，您可以向办案机关提交书面申请，说明手机对您的生活或工作的必要性，如作为支付工具、紧急联络需求等。
提供证明材料：附上工作证明、医疗记录（如需紧急联系时）等证明材料，以佐证手机使用的合理性。
协商替代方案：若手机确为关键证据，您可以提议备份数据后由家属保管设备，或仅允许在特定时段使用，以平衡证据保全与您的生活需求。
四、适时跟进与沟通
了解案件进展：定期与办案机关沟通，了解案件进展及手机扣押的处理情况。这有助于您及时掌握信息，为后续行动提供依据。
提醒返还手机：若案件已侦查终结且手机与案件无关，您应及时提醒办案机关返还手机。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，对查明确实与案件无关的财物，应在三日以内解除查封、扣押并退还原主。
五、依法提出申诉或控告
若您发现办案机关存在违法扣押手机的情形，如扣押的手机明显与案件无关或超过法定期限仍未返还等，您可以向办案机关的上级部门、同级人民检察院等相关部门提出申诉或控告。申诉时，请准备好取保候审决定书、手机被扣押的相关凭证等材料，以证明自己的主张。
总结与建议：
在整个过程中，与办案机关保持密切沟通至关重要。了解案件进展、手机扣押的具体原因及处理方式，有助于您更好地维护自己的合法权益。同时，保留好相关证据也是关键。若您对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。