当您在取保候审期间发现手机被扣押时，这通常意味着手机可能与案件有关，其内存储的电子数据可能作为证明案件事实的证据。面对这种情况，您可以按照以下步骤来合理处理，并保障自己的合法权益：

一、了解扣押原因与法律依据

1. 询问扣押原因：首先，您应向办案机关明确询问扣押手机的具体原因，了解手机与案件的关联性。办案人员通常会告知您，手机中可能存储有与犯罪事实相关的短信、聊天记录、转账记录等电子数据。

2. 知晓法律依据：根据《刑事诉讼法》第一百四十一条，侦查人员有权在勘验、搜查中查封、扣押与案件有关的财物、文件。若手机属于涉案证据或可能妨碍诉讼活动，公安机关可依法扣押。

二、确认扣押程序是否合法

1. 核查手续：要求办案机关出示《扣押决定书》或相关法律文书，明确扣押的依据和期限。

2. 了解权利：扣押时应制作清单并由您签字确认，同时办案机关应告知您申请取回的权利及途径。若未履行上述程序，您可向办案单位提出异议。

三、申请取回手机

1. 提交书面申请：在案件查清后，若未发现您有相关犯罪事实或其他需要扣押的情形，您可向办案机关提交书面申请，要求解除对手机的扣押并返还。在申请中，您可以说明手机对生活或工作的必要性，如作为支付工具、紧急联络需求等。

2. 提供证明材料：为了支持您的申请，您可以提供工作证明、医疗记录（如需紧急联系时）等证明材料，佐证手机使用的合理性。

3. 协商替代方案：若手机确为关键证据，您可与办案机关协商，提议备份数据后由家属保管设备，或仅允许在特定时段使用，以平衡证据保全与您的生活需求。

四、寻求法律救济

1. 复议复核：若您对扣押决定不服，可在收到通知后三日内向作出决定的公安机关申请复议；对复议结果仍不服的，可向上一级公安机关提请复核。

2. 律师介入：若您对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议委托律师调取扣押卷宗，分析扣押行为的合法性，并通过检察院监督或法院诉讼来维权。

3. 投诉举报：若您发现办案机关存在违法扣押手机的情形，如无手续强行扣押或超过法定期限仍未返还等，您可向同级检察院或上级公安机关纪检监察部门反映。

五、注意事项

1. 避免干扰侦查：在取回手机前，您不得擅自删除手机数据或破坏证据，否则可能承担法律责任。

2. 配合后续调查：即使取回手机，您仍需按办案机关的要求随时接受询问或提供相关信息。

3. 保留沟通记录：建议您保存与办案人员的对话录音、短信等凭证，以备后续争议解决。

在整个过程中，与办案机关保持密切沟通至关重要。通过了解案件进展、手机扣押的具体原因及处理方式，您可以更好地维护自己的合法权益。同时，保留好相关证据也是关键。希望这些建议能对您有所帮助。