结论：将钱还给母亲的儿子，不一定能算作还清了对母亲的借款，具体是否还清需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、还款对象与借款合同的关系
借款合同相对性：根据合同法的原则，借款合同具有相对性，即借款人和出借人是合同双方当事人，还款应当向出借人进行。在你的情况中，出借人是你的母亲，因此，从法律上讲，你应当将借款归还给你的母亲。
还款对象错误：如果你将钱还给了你母亲的儿子（即你的兄弟或其他亲属），而这个人并非借款合同的当事人，那么这种还款行为在法律上可能不被视为对原借款合同的履行。除非你的母亲明确授权其儿子代为接收还款，或者事后对你的还款行为进行了追认。
二、可能构成还款的情况
母亲授权或追认：如果你的母亲事先明确授权其儿子代为接收你的还款，或者在你将钱还给其儿子后，你的母亲对此行为进行了追认（例如，通过书面、口头或其他方式表示同意），那么这种还款行为在法律上可能被视为有效。
债务转移：如果在你借款后，你的母亲与她的儿子之间达成了债务转移的协议，即你的母亲将你对她的债务转移给了她的儿子，并且这种转移得到了你的同意，那么在这种情况下，你将钱还给母亲的儿子也可以视为还清了借款。但这种情况需要明确的债务转移协议和你的同意作为前提。
三、法律建议
确认还款对象：为了避免不必要的纠纷，建议你直接与你的母亲确认还款事宜，确保将钱归还给正确的对象。
保留还款证据：无论你选择向谁还款，都应当保留好还款的证据，如转账记录、收条等，以便在发生纠纷时能够证明自己的还款行为。
咨询专业意见：如果你对还款事宜存在疑问或担忧，建议咨询专业的法律人士，以便获得更具体、更准确的法律建议。
总结：将钱还给母亲的儿子不一定能算作还清了对母亲的借款，具体是否还清需根据实际情况判断。为了避免纠纷和风险，建议你直接与母亲确认还款事宜，并保留好还款证据。如有需要，可以向我进一步咨询相关法律问题。