如果合同中已经约定了仲裁条款，那么在发生合同纠纷时，双方应首先依据该仲裁条款通过仲裁方式解决争议。以下是对此问题的详细分析：

一、仲裁条款的效力与执行

1. 仲裁意愿的明确性：合同中的仲裁条款是双方当事人自愿将争议提交仲裁解决的明确表示。一旦合同生效，该仲裁条款即对双方产生约束力，双方应遵守并执行。
2. 仲裁机构的选定：仲裁条款中通常会明确选定一个具体的仲裁机构，如中国国际经济贸易仲裁委员会、北京仲裁委员会等。在发生争议时，双方应将争议提交至该选定的仲裁机构进行仲裁。
3. 仲裁程序的启动：根据仲裁机构的仲裁规则，一方当事人可以向仲裁机构提交仲裁申请，启动仲裁程序。仲裁机构在受理申请后，会按照规定的程序进行仲裁，包括组成仲裁庭、进行庭审、作出裁决等。

二、仲裁的优势与特点

1. 高效性：仲裁程序通常比诉讼程序更为高效，能够更快地解决争议，减少当事人的时间和成本投入。
2. 专业性：仲裁机构通常拥有专业的仲裁员队伍，他们具备丰富的法律知识和实践经验，能够更准确地理解和适用法律，作出公正的裁决。
3. 保密性：仲裁程序通常具有较高的保密性，仲裁裁决一般不对外公开，有助于保护当事人的商业秘密和隐私。
4. 终局性：仲裁裁决通常是终局的，对双方当事人均具有约束力。一旦裁决作出，双方应自觉履行裁决结果，不得再就同一争议向法院起诉或向其他机构提出变更仲裁裁决的请求。

三、应对合同中仲裁条款的建议

1. 仔细审查合同：在签订合同时，应仔细审查合同中的仲裁条款，确保条款内容明确、合法、有效。如果对仲裁条款有疑问或不明确的地方，应及时向对方提出并协商修改。
2. 了解仲裁机构与规则：在选定仲裁机构后，应了解该仲裁机构的仲裁规则、仲裁员队伍、仲裁程序等相关信息，以便在发生争议时能够更好地应对。
3. 准备仲裁材料：在发生争议时，应按照仲裁机构的要求准备仲裁材料，包括仲裁申请书、证据材料等。这些材料应真实、完整、合法，能够充分支持自己的主张。
4. 积极参与仲裁程序：在仲裁程序中，应积极参与庭审、辩论等环节，充分表达自己的观点和主张。同时，也应尊重仲裁庭的裁决结果，自觉履行裁决义务。

四、特殊情况的处理

1. 仲裁条款无效或不存在：如果合同中的仲裁条款被认定无效或不存在，或者双方对仲裁条款的效力有争议，那么双方可以协商选择其他争议解决方式，如诉讼、调解等。
2. 仲裁机构无法受理：如果选定的仲裁机构因某种原因无法受理争议，如仲裁机构不存在、仲裁机构拒绝受理等，那么双方可以协商选择其他仲裁机构或争议解决方式。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。