合同上旷工一天罚三天的条款，在大多数情况下是无效的，这并不意味着整个合同无效，而是指该特定条款因违反法律法规而无效。以下从法律角度、合理性分析以及应对建议三个方面进行详细说明：
法律角度分析
法律依据明确：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。旷工一天扣三天工资的做法，显然违反了这一规定，构成了克扣工资。
- 《工资支付暂行规定》第十六条也明确规定，若劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除的工资不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。旷工一天扣三天工资的做法，同样超出了这一限制。
规章制度合法性：
- 用人单位的规章制度必须合法且经过民主程序制定，并向劳动者公示。未经法定程序制定或未向劳动者公示的规章制度，对劳动者不具有约束力。因此，即使合同中有旷工一天罚三天的条款，如果该条款未经民主程序制定或未向劳动者公示，也是无效的。
合理性分析
惩罚与过错不匹配：
- 旷工一天仅表示劳动者未提供这一天的劳动，用人单位有权不支付这一天的工资作为惩罚。但扣除三天工资则让劳动者承担了超出其过错程度的责任，这种惩罚措施过于严厉，与劳动者的过错程度不相匹配。
影响员工积极性：
- 过度的惩罚可能会打击员工的工作积极性，导致员工产生不满情绪，甚至引发劳动纠纷。这不利于企业的长期发展和员工关系的和谐稳定。
不利于企业管理：
- 企业应该通过合理的管理制度和激励机制来提高员工的出勤率和工作效率，而不是依靠严厉的惩罚措施。旷工一天罚三天的做法，可能让员工感到不公平和不被尊重，从而降低对企业的忠诚度和归属感。
应对建议
了解法律法规：
- 劳动者应了解自己的合法权益和法律法规的相关规定，以便在权益受到侵害时能够及时维护自己的利益。如果发现合同中有旷工一天罚三天的条款，可以明确指出该条款的违法性。
与企业沟通：
- 如果认为企业的扣款规定不合理，可以与企业进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。例如，可以提出按照实际旷工天数扣除工资，或者根据旷工给企业造成的实际损失来协商赔偿金额。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果企业坚持执行不合理的扣款规定，劳动者可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求企业返还被克扣的工资并承担相应的法律责任。如果对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼。
总结来说，合同上旷工一天罚三天的条款在大多数情况下是无效的。劳动者在面对这种情况时，应了解自己的合法权益和法律法规的相关规定，与企业进行沟通协商，并在必要时申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的利益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。