当法院认定法律关系与当事人主张的不一致，并因此驳回诉讼请求时，其法律依据主要来源于《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第五十三条第一款。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第五十三条第一款：“诉讼过程中，当事人主张的法律关系性质或者民事行为效力与人民法院根据案件事实作出的认定不一致的，人民法院应当将法律关系性质或者民事行为效力作为焦点问题进行审理。但法律关系性质对裁判理由及结果没有影响，或者有关问题已经当事人充分辩论的除外。” 这一条款明确规定了，在当事人主张的法律关系与法院认定不一致时，法院应如何处理。

二、法院的处理方式

1. 焦点审理：法院会将法律关系性质或民事行为效力作为焦点问题进行审理，确保当事人充分行使辩论权。这是为了保障案件的公正性和合法性，使双方当事人都有机会就法律关系的性质进行充分的辩论和阐述。

2. 变更诉讼请求：若当事人根据法庭审理情况变更诉讼请求的，法院应当准许，并可以根据案件的具体情况重新指定举证期限。这体现了法院对当事人处分权的尊重，同时也为当事人提供了修正自己主张的机会。

3. 直接裁判：若法律关系性质或民事行为效力已是争议焦点并充分辩论，法院可直接依据认定的法律关系进行裁判。这是为了确保案件能够及时、有效地得到解决，避免因为法律关系认定问题而导致的诉讼拖延。

三、当事人可能面临的风险及建议

1. 风险：若当事人坚持错误的法律关系且经法院释明后仍不改正，可能导致诉请被驳回。这是因为法院在审理案件时，必须依据事实和法律进行裁判，如果当事人的主张与事实和法律不符，且经法院释明后仍不改正，那么法院只能依法驳回其诉请。

2. 建议：

   • 积极配合法院释明：当事人应当认真听取法院的意见，充分理解法院释明的内容，并在必要时及时变更诉讼请求。这是为了确保自己的权利得到有效维护，避免因为坚持错误的法律关系而导致的诉请被驳回。
   • 寻求专业法律帮助：在涉及复杂法律关系时，当事人可以寻求专业律师的帮助，以确保准确分析法律关系并制定合理的诉讼策略。律师具有专业的法律知识和丰富的实践经验，能够为当事人提供有效的法律建议和帮助。

四、特殊情况的处理

• 若当事人坚持其诉讼请求而不变更：法院应作出程序性处理，如裁定驳回起诉（而非诉讼请求）。这是为了维护法律的尊严和权威，确保案件的处理结果公正合法。
• 法院释明权的行使：法院在行使释明权时，应避免对当事人处分权和审判中立原则造成不当冲击。释明权是法院为了保障当事人诉讼权利而行使的一种权力，但必须在尊重当事人处分权和审判中立原则的前提下进行。

综上所述，当法院认定法律关系与当事人主张的不一致时，会依据相关法律法规进行审理，并可能通过释明、焦点审理、允许变更诉讼请求或直接裁判等方式处理。作为当事人，应当积极配合法院的工作，确保自己的权利得到有效维护。如果您在法律关系认定方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。