针对您提出的“申报两项工伤只定一项工伤，工伤认定是否有问题”的疑问，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
首先，要明确的是，工伤认定的过程是基于职工所遭受的实际伤害情况，以及是否符合《工伤保险条例》中规定的工伤认定情形来进行的。如果职工在同一工作过程中或同一事故中遭受了多项伤害，且这些伤害都符合工伤认定的条件，那么理论上这些伤害都应该被认定为工伤。
然而，在实际操作中，可能会出现申报多项工伤但只认定一项的情况。这可能是由于多种原因造成的，比如：
证据不足：对于某些伤害，可能由于缺乏足够的医疗证据或现场证据，导致社会保险行政部门无法确认其是否符合工伤认定的条件。
伤害程度不满足认定标准：虽然职工可能遭受了多项伤害，但其中某些伤害的程度可能并未达到工伤认定的标准，因此未被认定为工伤。
申报材料不完整或存在误导：如果申报工伤时提供的材料不完整、不准确或存在误导性信息，也可能影响工伤认定的结果。
针对您的情况，如果认为只认定了一项工伤而忽略了其他符合条件的伤害，您可以采取以下措施：
补充证据：收集并提交更多关于未被认定工伤的伤害的医疗证据、现场照片、证人证言等，以证明这些伤害也符合工伤认定的条件。
申请复查或复议：如果对工伤认定结果有异议，可以向社会保险行政部门申请复查或复议，要求重新审核并认定未被认定的工伤。
寻求法律援助：如果复查或复议结果仍然不满意，您可以考虑寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
此外，需要强调的是，用人单位在申报工伤时应当如实提供相关信息和材料，不得弄虚作假或隐瞒事实。如果用人单位存在违规行为，如虚构劳动关系、伪造证明材料等，不仅会影响工伤认定的结果，还可能面临法律责任。
综上所述，申报两项工伤只定一项工伤并不一定意味着工伤认定有问题，但如果您认为存在遗漏或错误认定的情况，可以通过补充证据、申请复查或复议等方式来维护自己的权益。同时，用人单位也应当严格遵守相关法律法规和规定，确保工伤认定的公正性和准确性。