在房屋租赁关系中，关于房租逾期被罚滞纳金的问题，首先需要明确的是，“滞纳金”在民事合同关系中，特别是房屋租赁关系中，并不准确，正确的法律术语应为“违约金”。滞纳金通常是行政强制执行中的概念，由行政机关执行，并不适用于我们日常的房屋租赁等民事合同关系。
接下来，我们详细分析房租逾期被罚违约金（原问题中的“滞纳金”）的合法性：
一、合法性基础
合同意思自治原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方有权在平等、自愿的基础上，就合同内容（包括违约责任）进行协商并达成一致。因此，如果租赁合同中明确约定了逾期支付租金的违约金条款，且该条款不存在无效或可撤销的情形，那么该违约金条款对双方具有法律约束力。
违约金的约定与调整：
- 《民法典》允许当事人在合同中约定违约金，并规定了违约金的调整机制。如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或仲裁机构可根据请求予以增加；如果约定的违约金过分高于造成的损失，同样可以请求适当减少。这意味着违约金的数额应当合理，旨在惩罚违约行为并补偿守约方的损失。
二、合法性的具体判断
违约金比例的合理性：
- 租房合同中约定的逾期违约金比例（如5%）是否合法，需结合合同的实际履行情况、违约可能造成的损失等因素综合判断。如果违约金明显高于或低于实际损失，当事人可以请求法院或仲裁机构进行调整。
地区性规定与司法实践：
- 部分地区可能对租房合同中的违约金标准有特别规定，如设有上限或下限。在签订合同时，应了解并遵守当地的相关规定。同时，法院在处理违约金纠纷时，也会根据具体情况进行裁量，确保违约金的约定既不过高也不过低。
三、实际操作建议
明确约定违约金条款：
- 在签订租房合同时，双方应明确约定逾期支付租金的违约金比例，并确保该约定不违反法律、行政法规的强制性规定。
保留相关证据：
- 出租方应妥善保管承租方逾期支付租金的记录等证据，以便在主张违约金时提供证明。
争议解决途径：
- 若双方对违约金的约定存在争议，应首先通过协商解决；协商不成的，可以向法院提起诉讼或申请仲裁，由法院或仲裁机构根据具体情况作出裁决。
总结：房租逾期被罚违约金（原问题中的“滞纳金”）在合法有效的租赁合同中，且违约金条款合理、不违反法律法规强制性规定的情况下，是合法的。但违约金的数额应合理设定，既要考虑对违约行为的惩罚性，也要确保不会过分高于实际损失。如遇纠纷，当事人可寻求法律途径解决。