医疗期满后协商解除劳动合同，年平均工资的计算基数通常以解除劳动合同前12个月的平均工资为准，但需结合医疗期内的工资支付情况综合判断。具体分析如下：

1. 一般情况下的计算标准
   根据《劳动合同法》第四十七条及《劳动合同法实施条例》第二十七条，经济补偿金的月工资标准为劳动者在劳动合同解除前12个月的平均工资。若医疗期满后双方协商解除合同，且医疗期内工资正常发放（如按原工资的80%支付病假工资），则直接以解除前12个月的实发工资总额（含病假工资）除以12个月，得出月平均工资作为计算基数。

2. 医疗期内工资异常时的调整规则
   若医疗期内工资低于当地最低工资标准的80%，或用人单位未依法支付病假工资，则需分情况处理：

   • 经济补偿金计算：根据《劳动合同法实施条例》第二十七条，月工资低于当地最低工资标准的，按最低工资标准计算经济补偿金。例如，若解除前12个月中部分月份工资低于最低工资标准，则这些月份按最低工资标准计入平均工资计算。
     
   • 赔偿金计算：若用人单位违法解除合同（如未安排返岗或未协商一致即终止合同），赔偿金为经济补偿金的2倍，此时仍以调整后的月平均工资为基数。

3. 特殊情形下的计算例外

   • 医疗期未满即解除：若用人单位在医疗期内单方解除合同（如以“不能胜任工作”为由），可能构成违法解除，需支付赔偿金。此时月工资标准仍按解除前12个月平均工资计算，但需注意医疗期内工资是否合法支付。
     
   • 协商解除的自愿性：若劳动者自愿接受低于法定标准的补偿，需明确书面约定，否则可能因显失公平被撤销。建议协商时保留工资记录、协商过程证据，以避免纠纷。

建议：

• 计算时需核对工资条、银行流水，确认医疗期内工资是否符合法定标准；
  
• 若对计算结果有争议，可要求用人单位提供工资计算明细，或向劳动监察部门投诉；
  
• 协商解除时，建议书面约定补偿金额及计算方式，避免口头协议引发纠纷。
  

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