结论前置：法官在质证中否定的证据若未经过合法质证程序而直接作为判案依据，是违法的；但若证据经过合法质证程序后被否定，并依法未被采纳为判案依据，则是合法的。
一、质证程序的重要性与法律规定
质证是诉讼过程中的关键环节，它确保了当事人对证据的充分审查和质疑，从而保障了司法的公正性和当事人的合法权益。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十八条的规定，证据应当在法庭上出示，并由当事人互相质证。这一规定明确了质证在诉讼中的法定地位，任何未经质证的证据原则上不得作为认定案件事实的依据。
二、法官否定证据的合法情形
证据经过合法质证程序后被否定：
- 在质证过程中，当事人有权对对方出示的证据进行质证，包括对其真实性、关联性和合法性提出质疑。
- 法官会根据质证情况，结合法律规定和案件事实，对证据的证明力进行评判。如果证据存在瑕疵或不符合法律规定，法官有权依法否定其证明力，并决定不将其作为判案依据。
- 这种否定是基于合法质证程序的结果，因此是合法的。
证据明显不符合证据规则要求，法官依职权直接排除：
- 在某些情况下，证据可能明显缺乏关联性、真实性或合法性，以至于无需经过质证程序即可直接排除。
- 法官在行使审判权时，有权对这类证据进行审查，并依职权直接排除，不进行质证。
- 这种行为虽然未经过质证程序，但属于法官对证据的合法审查处理，并不构成违法。不过，法官应当说明排除的理由，并确保当事人的知情权得到保障。
三、法官否定证据的违法情形
- 未经过合法质证程序而否定证据：
- 如果法官在质证过程中未给予当事人充分的质证机会，或者未按照法定程序组织质证，就直接否定证据的证明力，并作为判案依据，这是违法的。
- 这种行为剥夺了当事人对证据发表意见的权利，可能导致认定事实的证据未经充分审查核实，进而损害当事人的合法权益和司法的公正性。
四、对当事人的建议
积极行使质证权利：
- 在诉讼过程中，当事人应当积极行使质证权利，对对方出示的证据进行充分的审查和质疑。
- 如果发现法官未按照法定程序组织质证，或者剥夺了自己的质证权利，应当及时提出异议，并要求法官依法纠正。
寻求法律援助：
- 如果当事人对质证程序或法官的否定证据行为有疑问或不满，可以寻求专业律师的法律援助。
- 律师可以帮助当事人分析案件情况，提供法律意见，并代表当事人与法官沟通协商，维护当事人的合法权益。
作为宋子明律师，我专注于刑事辩护、取保候审、律师会见、经济犯罪、死刑辩护、毒品犯罪等领域。如果您在诉讼过程中遇到任何法律问题或疑问，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面、准确的法律解答和帮助。