工厂请假扣加班费的计算方式需结合具体情形判断，核心结论如下：

1. 若工厂规章制度合法且已公示，请假扣加班费需符合制度规定
   根据《劳动合同法》第四条，工厂可通过民主程序制定规章制度（如考勤、薪酬制度），但需满足三个条件：
   

• 内容合法（不得违反《劳动法》《工资支付暂行规定》等强制性规定）；
  
• 经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表协商确定；
  
• 已向劳动者公示或告知（如培训、签字确认、公示栏张贴等）。
  若制度规定“请假需扣除对应加班费”，且符合上述条件，则工厂可按制度执行。例如：员工月加班20小时，请假5小时，工厂可按比例扣除5小时加班费。
  

1. 若工厂制度违法或未公示，扣加班费可能被认定为违法
   若工厂制度存在以下情形，扣除加班费的行为无效：
   

• 扣除比例不合理：如《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者原因造成经济损失需赔偿的，每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。若工厂以“请假”为由超额扣除加班费，可能违法；
  
• 未区分加班类型：加班费分平时加班（1.5倍工资）、周末加班（2倍工资）、法定节假日加班（3倍工资）。若工厂未区分类型统一扣除，可能损害劳动者权益；
  
• 未公示制度：若工厂未通过合法方式公示制度，劳动者可主张“不知情”，要求工厂返还扣除的加班费。
  

1. 特殊情形：病假、事假的扣除规则
   

• 病假：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，劳动者在医疗期内享有病假工资（不得低于当地最低工资标准的80%）。若工厂以“请假”为由扣除病假期间的加班费，可能违法；
  
• 事假：事假期间劳动者未提供劳动，工厂可不支付工资，但若劳动者已提前完成加班任务，工厂扣除加班费需符合制度规定或双方约定。
  

建议：若工厂扣除加班费的行为存在争议，劳动者可先与工厂协商，要求提供制度依据；协商不成可向当地劳动监察大队投诉，或申请劳动仲裁（需提供劳动合同、工资条、考勤记录等证据）。如有进一步疑问，可直接向我咨询。