检察院会根据具体情况，对认罪认罚的罪行和未认罪认罚的罪行分别进行处理，并综合考量后作出最终决定。具体来说：

1. 对认罪认罚的罪行：

   • 检察院会依据犯罪嫌疑人的认罪认罚态度，结合案件事实、证据以及法律规定，提出相应的量刑建议。
   • 如果犯罪嫌疑人真诚悔罪，愿意接受处罚，且案件事实清楚、证据确实充分，检察院可能会提出从宽处理的量刑建议，如减轻处罚、适用缓刑等。

2. 对未认罪认罚的罪行：

   • 对于犯罪嫌疑人未认罪认罚的罪行，检察院会继续深入调查，收集证据，确保案件事实清楚、证据确实充分。
   • 在提起公诉时，检察院会就未认罪认罚的罪行向法院提出指控，并依据法律规定和案件事实，提出相应的量刑建议。

3. 综合考量与最终决定：

   • 检察院在处理此类案件时，会综合考虑犯罪嫌疑人的认罪认罚态度、案件事实、证据情况以及法律规定等多方面因素。
   • 如果犯罪嫌疑人对部分罪行认罪认罚，但对其他罪行拒不认罪，检察院会根据具体情况，分别就认罪认罚的罪行和未认罪认罚的罪行提出量刑建议，并在起诉书中明确说明。
   • 最终，法院会根据检察院的指控和量刑建议，结合庭审情况，依法作出判决。

建议：如果面临此类情况，犯罪嫌疑人应积极配合检察院的工作，如实供述自己的罪行，争取从宽处理。同时，也可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。