当遇到主犯不认罪而从犯认罪的情况时，检察院会依据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释的规定，全面、公正地处理案件。以下是检察院在此类情况下的具体做法：
一、证据审查阶段
全面核查与审查证据：
- 检察院会对侦查机关移送的全部证据材料进行细致审查和核实，这包括对证明主犯和从犯有罪的证据，以及可能证明他们无罪或罪轻的证据的全面审查。
- 如果证据存在瑕疵或不足，检察院可以退回公安机关进行补充侦查，要求进一步收集、调取证据，以确保案件的证据链完整且合法。
讯问嫌疑人及听取多方意见：
- 在审查起诉阶段，检察院会对主犯和从犯分别进行讯问，了解他们不认罪或认罪的原因和态度。
- 同时，检察院还会听取辩护人、值班律师、被害人及其诉讼代理人的意见，确保案件的公正处理，并充分考虑各方的观点和证据。
二、决定起诉阶段
提起公诉：
- 若经审查，证据确实、充分，能够排除合理怀疑地证明主犯和从犯实施了犯罪行为，即使主犯不认罪，检察院也会依法向人民法院提起公诉。公诉书中将详细阐述指控的犯罪事实、证据及适用的法律条款。
不起诉决定：
- 若对于主犯或从犯的证据不足，无法达到认定其有罪的证明标准，检察院将作出不起诉决定，遵循疑罪从无的原则，确保不冤枉无辜。
量刑建议（针对从犯）：
- 对于认罪的从犯，检察院会根据其犯罪情节、悔罪表现等因素，提出具体的量刑建议，供法院参考。然而，对于不认罪的主犯，检察院则无法提出具体的量刑建议，但这不影响案件的依法处理。
三、庭审支持公诉阶段
举证质证：
- 在法庭上，检察官会通过出示各类证据来证明主犯和从犯的犯罪行为。针对主犯不认罪的情况，检察官会特别强调证据之间的关联性和证明力，以构建完整的证据链。
反驳辩解：
- 对于主犯的不认罪辩解和理由，检察官会依据事实和法律进行有力反驳，确保案件的公正审理。同时，也会尊重从犯的认罪态度，并在量刑时予以考虑。
四、法律后果与法院判决
主犯的法律后果：
- 主犯不认罪将丧失获得从宽处理的机会，这可能对其最终的量刑产生影响。法院在审理时，会重视证据链的完整性与合法性，不轻信口供。即便主犯不认罪，只要证据确实、充分，能够排除合理怀疑，法院也可以认定其有罪并作出有罪判决。
从犯的法律后果：
- 从犯认罪态度良好，且证据确实、充分的情况下，法院可能会根据其犯罪情节和悔罪表现，依法给予从轻或减轻处罚。
法院的依法判决：
- 法院会根据庭审情况和现有证据，遵循法律法规，作出公正、公平的判决。若证据不足或存在合理怀疑，法院则会作出无罪判决或疑罪从无的处理。
综上所述，当主犯不认罪而从犯认罪时，检察院会依法全面审查证据、决定是否提起公诉，并在庭审中支持公诉。法院则会根据证据和法律规定，独立、公正地作出判决。这一过程中，检察院和法院都会充分保障犯罪嫌疑人的合法权益和审判的公正性。