工伤后与用人单位协商放弃单位赔偿部分，该协议的效力需根据具体情况综合判断，但大多数情况下可能无效，特定情况下可能有效。以下是对此问题的详细分析：

协议可能无效的情形

1. 存在重大误解或显失公平：

   • 如果劳动者对工伤认定及赔偿标准缺乏足够认知，在签订放弃赔偿协议时存在重大误解，例如不了解自己应获得的赔偿项目和数额，或者协议约定的赔偿金额与法定赔偿金额相差悬殊，这种协议可能被认定无效或可撤销。例如，劳动者实际应获赔50万元，但协议仅约定赔偿5万元，此类条款很可能因显失公平而被法院撤销。

2. 存在欺诈、胁迫或乘人之危：

   • 若用人单位利用劳动者处于危困状态、缺乏判断能力等情形，迫使劳动者签订放弃赔偿协议，或通过欺诈、胁迫手段让劳动者违背真实意愿签订协议，此类协议不具有法律效力。比如，用人单位以不提供治疗费用或解雇相威胁，迫使劳动者签订放弃赔偿的协议。

3. 违反法律强制性规定：

   • 即使协议是劳动者自愿签订的，也可能因为违反了法律的强制性规定而无效。例如，协议排除了劳动者依法享有的其他权利，或约定的赔偿金额明显低于法律规定的标准。根据《工伤保险条例》等相关法律法规，职工因工作遭受事故伤害或患职业病进行治疗时，应享受工伤医疗待遇，相关费用由工伤保险基金支付，用人单位不得通过协议免除自身法定责任。

协议可能有效的情形

• 劳动者充分了解权益且真实自愿：
  • 如果劳动者完全清楚自己依法享有的工伤赔偿权益，包括赔偿项目、计算标准等，并且是在完全自愿、没有受到任何不当干扰的情况下与用人单位达成放弃赔偿的协议，同时该协议的内容不违反法律法规的强制性规定，也不损害国家、集体和他人的合法权益，那么这种协议可能具有法律效力。但这种情况较为少见，且需要严格的证据支持。

劳动者权益保护建议

1. 保留证据：

   • 劳动者应妥善保存劳动合同、工资单、医疗记录、工伤认定书等材料，作为维权依据。这些证据在后续可能发生的法律纠纷中至关重要。

2. 及时咨询并寻求法律帮助：

   • 在签订任何放弃赔偿的协议前，劳动者应充分了解自己的权益，并在必要时向我咨询。如果已经签订了此类协议但后来发现权益受到侵害，也应及时寻求法律帮助，通过法律途径寻求救济。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果发现用人单位存在违法行为，如未缴纳工伤保险、通过协议免除自身法定责任等，劳动者可以向当地人社局等劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。

综上所述，工伤后与用人单位协商放弃单位赔偿部分的协议效力需根据具体情况综合判断。劳动者在签订此类协议前应充分了解自己的权益，并在必要时寻求我的法律帮助。如果权益受到侵害，应依法维护自己的合法权益。