解除与一名工作十二年的员工的劳动关系是否违法，不能一概而论，这取决于解除的具体原因和程序是否符合法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、合法解除的情况
协商一致解除：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这种情况下，无论员工工作年限多长，只要双方达成一致，解除劳动关系就是合法的。
员工过错解除：
- 如果员工存在严重违反用人单位规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害、被依法追究刑事责任等情形，用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同，且无需支付经济补偿。这种情况下，解除与工作十二年的员工的劳动关系也是合法的。
经济性裁员：
- 在特定情况下，如用人单位依照企业破产法规定进行重整、生产经营发生严重困难等，用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十一条的规定进行经济性裁员。虽然这种情况下解除劳动关系需要遵循一定的程序和条件，但只要符合法律规定，解除与工作十二年的员工的劳动关系也是合法的。不过，对于工作年限较长的员工，用人单位在裁员时应当给予更多的关注和考虑，如优先留用等。
二、违法解除的情况
无合法理由解除：
- 如果用人单位没有合法理由，如员工没有过错、未协商一致等，就单方面解除与工作十二年的员工的劳动关系，那么这种解除就是违法的。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十八条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行；劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照本法第八十七条规定支付赔偿金。
未履行法定程序解除：
- 即使用人单位有合法理由解除劳动关系，但如果未按照法定程序进行，如未提前通知员工、未听取员工意见、未向工会说明情况等，也可能构成违法解除。这种情况下，用人单位同样需要承担相应的法律责任。
三、特殊保护情况
- 对于工作年限较长的员工，如在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的员工，用人单位在解除劳动关系时应当更加谨慎。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，这种情况下用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同（除非员工存在第三十九条规定的过错情形）。虽然这一条款并未直接涉及工作十二年的员工，但体现了法律对工作年限较长员工的特殊保护倾向。因此，在解除与工作十二年的员工的劳动关系时，用人单位也应当充分考虑员工的实际情况和贡献，避免滥用解除权。
总结与建议：
- 解除与一名工作十二年的员工的劳动关系是否违法，取决于解除的具体原因和程序是否符合法律规定。
- 用人单位在解除劳动关系时，应当遵循合法、公平、公正的原则，确保解除行为的合法性和合理性。
- 如果员工对解除劳动关系有异议，可以通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
- 如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。