针对员工不认可年终奖发放制度的问题，这确实是一个涉及劳动者权益和用人单位管理权的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确年终奖的法律性质。年终奖是用人单位对劳动者一年来工作业绩的肯定，属于劳动报酬的组成部分。虽然现行法律法规并未硬性规定用人单位必须设定或如何设定年终奖，但一旦用人单位与劳动者对年终奖的发放标准或条件有约定，就应当遵循这些约定。若无约定或约定不明，则应依据用人单位内部经民主程序制定的规章制度、既往发放惯例以及发放条件的相关要素是否成就等，来综合评定是否应发放年终奖。

接下来，针对员工不认可年终奖发放制度的情况，我们可以从以下几个方面来处理：

1. 沟通解释：

   • 用人单位应主动与员工进行沟通，解释年终奖的发放制度、依据和目的。
   • 倾听员工的意见和诉求，了解他们不认可的具体原因。

2. 审查制度合理性：

   • 用人单位应审查自身的年终奖发放制度是否合理、公平、透明。
   • 如果制度存在不合理之处，应及时进行修订和完善，以确保制度的公正性和可接受性。

3. 提供证据支持：

   • 如果用人单位以企业经营困难、劳动者年度考核不合格等为由拒发年终奖，应就这些主张提供充分的证据支持。
   • 证据可以包括财务报表、考核记录等，以证明拒发年终奖的合理性和必要性。

4. 参考既往惯例和行业实践：

   • 在处理年终奖争议时，可以参考用人单位既往的发放惯例和行业内的普遍实践。
   • 如果用人单位连续多年发放年终奖，且员工对此有合理预期，那么突然改变发放制度可能会引发争议。

5. 寻求法律途径解决：

   • 如果双方无法就年终奖发放制度达成一致，员工可以通过法律途径来维护自己的权益。
   • 用人单位也应积极应对法律诉讼，提供充分的证据来支持自己的主张。

6. 预防未来争议：

   • 为避免未来因年终奖发放引发劳动争议，用人单位应在劳动合同中明确年终奖的发放条件、发放标准等。
   • 或者通过规章制度形式对年终奖的发放规则作出细致规定，并确保这些规定经过民主程序制定且为员工所知悉。

以实际案例为例，如某公司因未就年终奖发放办法及不予发放原因举证而被判败诉。这提醒我们，用人单位在处理年终奖争议时，必须承担举证责任，提供充分的证据来支持自己的主张。否则，可能会面临法律上的不利后果。

综上所述，处理员工不认可年终奖发放制度的问题需要用人单位与员工进行充分沟通、审查制度合理性、提供证据支持、参考既往惯例和行业实践、寻求法律途径解决以及预防未来争议。通过这些措施，我们可以更好地平衡劳动者和用人单位的利益，构建和谐、稳定的劳动关系。