工程挂靠协议无效时，其中约定的机具费用是否有效，需分情况讨论：

1. 若机具费用条款独立于挂靠协议的其他无效部分，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：

   • 在这种情况下，尽管挂靠协议整体无效，但机具费用条款可能因其独立性而仍然有效。这是因为，法律对于合同无效的规定，通常针对的是合同的整体效力，特别是那些违反法律、行政法规强制性规定或违背公序良俗的部分。如果机具费用条款本身并不涉及这些无效情形，且能够独立存在，那么它就有可能被认定为有效。
   • 举例：假设挂靠协议中除了约定挂靠关系外，还单独约定了机具的租赁费用、支付方式等条款，且这些条款并不违反任何法律法规，也不涉及挂靠关系的核心无效部分。那么，在挂靠协议被认定无效后，这些机具费用条款仍然可能被法院或仲裁机构认定为有效，并据此进行裁决。

2. 若机具费用条款与挂靠协议的其他无效部分紧密相连，或本身也违反法律、行政法规的强制性规定，或违背公序良俗：

   • 在这种情况下，机具费用条款很可能也会被认定为无效。因为，如果条款之间存在紧密的关联，或者条款本身就存在无效情形，那么它们就无法独立存在，也无法被单独认定为有效。
   • 举例：如果挂靠协议中的机具费用条款实际上是为了掩盖挂靠关系的非法目的而设定的，或者机具费用的支付方式、金额等明显不合理，违反了相关法律法规的规定，那么这些条款就很可能被法院或仲裁机构认定为无效。

法律背景与建议：

• 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的民事法律行为自始没有法律约束力。但是，这并不意味着无效合同中的所有条款都必然无效。如果合同中的某些条款能够独立存在，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么它们就有可能被认定为有效。
• 建议：在签订挂靠协议时，应尽量避免涉及违法违规的内容，确保协议的整体合法性。同时，对于机具费用等独立条款，也应进行仔细审查，确保其不违反任何法律法规的规定，也不与挂靠协议的其他无效部分紧密相连。如果挂靠协议被认定无效，且机具费用条款也存在无效情形，那么相关方应及时寻求法律救济，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。

可能法律后果：

• 如果机具费用条款被认定有效，那么相关方应按照条款约定履行支付义务，否则可能面临违约责任等法律后果。
• 如果机具费用条款被认定无效，那么相关方可能无法依据该条款主张权利，且可能因无效行为而承担一定的法律责任，如返还财产、赔偿损失等。

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