在编人员请假多年，年终奖是否会被扣除，这主要取决于请假的原因、时长以及单位的相关规章制度。以下是对这一问题的详细分析：
请假原因与时长的影响：
- 如果请假是因为合理的、符合单位规定的个人原因（如病假、产假、婚假等），且请假时长在单位规定的范围内，那么通常不会因此被扣除年终奖。因为这些假期是法律或单位规章制度所保障的，员工有权享受。
- 如果请假是因为无故旷工或违反单位规章制度，且请假时长较长，那么单位可能会根据规章制度扣除部分或全部年终奖。因为这种行为违反了单位的劳动纪律，单位有权进行相应的处罚。
单位规章制度的作用：
- 单位通常会制定详细的规章制度，明确年终奖的发放条件、标准和方式。这些规章制度是员工与单位之间劳动关系的组成部分，对双方都具有约束力。
- 如果单位的规章制度中明确规定了请假时长与年终奖发放的关系，那么员工应当遵守这些规定。如果员工违反了规定，单位有权根据规章制度进行处罚，包括扣除年终奖。
法律层面的考量：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，单位应当按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。年终奖作为劳动报酬的一部分，也应当受到法律的保护。
- 如果单位无正当理由扣除员工的年终奖，员工有权向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于在编人员来说，如果因特殊原因需要请假，应当提前了解并遵守单位的规章制度，确保自己的请假行为符合规定。
- 如果对单位的规章制度或年终奖发放有疑问，可以及时向单位的人力资源部门或相关负责人咨询，以明确自己的权益和义务。
- 如果单位无正当理由扣除了年终奖，员工可以依法维护自己的权益，通过调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。
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